Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SnrpfP62307 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SnrpfP62307 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SnrpfP62307 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SnrpfP62307 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SnrpfP62307 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SnrpfP62307 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SnrpfP62307 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SnrpfP62307 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SnrpfP62307 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SnrpfP62307 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SnrpfP62307 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SnrpfP62307 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SnrpfP62307 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SnrpfP62307 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SnrpfP62307 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SnrpfP62307 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SnrpfP62307 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SnrpfP62307 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SnrpfP62307 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SnrpfP62307 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SnrpfP62307 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SnrpfP62307 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SnrpfP62307 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SnrpfP62307 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SnrpfP62307 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SnrpfP62307 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SnrpfP62307 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SnrpfP62307 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SnrpfP62307 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SnrpfP62307 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SnrpfP62307 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SnrpfP62307 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SnrpfP62307 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SnrpfP62307 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SnrpfP62307 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SnrpfP62307 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SnrpfP62307 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SnrpfP62307 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SnrpfP62307 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SnrpfP62307 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SnrpfP62307 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SnrpfP62307 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SnrpfP62307 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SnrpfP62307 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SnrpfP62307 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SnrpfP62307 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SnrpfP62307 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SnrpfP62307 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SnrpfP62307 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SnrpfP62307 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SnrpfP62307 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SnrpfP62307 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SnrpfP62307 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SnrpfP62307 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SnrpfP62307 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SnrpfP62307 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SnrpfP62307 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SnrpfP62307 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SnrpfP62307 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SnrpfP62307 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SnrpfP62307 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SnrpfP62307 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SnrpfP62307 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SnrpfP62307 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SnrpfP62307 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SnrpfP62307 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SnrpfP62307 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SnrpfP62307 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SnrpfP62307 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SnrpfP62307 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SnrpfP62307 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SnrpfP62307 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SnrpfP62307 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SnrpfP62307 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SnrpfP62307 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SnrpfP62307 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SnrpfP62307 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SnrpfP62307 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SnrpfP62307 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SnrpfP62307 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SnrpfP62307 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SnrpfP62307 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SnrpfP62307 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SnrpfP62307 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SnrpfP62307 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SnrpfP62307 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SnrpfP62307 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SnrpfP62307 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SnrpfP62307 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SnrpfP62307 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SnrpfP62307 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SnrpfP62307 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SnrpfP62307 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SnrpfP62307 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SnrpfP62307 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SnrpfP62307 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SnrpfP62307 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SnrpfP62307 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SnrpfP62307 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms