Protein–RNA interactions for Protein: P61014

Pln, Cardiac phospholamban, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlnP61014 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PlnP61014 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PlnP61014 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PlnP61014 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PlnP61014 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PlnP61014 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PlnP61014 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PlnP61014 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PlnP61014 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PlnP61014 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PlnP61014 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PlnP61014 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PlnP61014 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PlnP61014 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PlnP61014 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PlnP61014 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PlnP61014 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PlnP61014 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PlnP61014 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PlnP61014 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PlnP61014 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PlnP61014 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PlnP61014 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PlnP61014 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PlnP61014 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PlnP61014 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PlnP61014 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PlnP61014 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PlnP61014 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PlnP61014 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PlnP61014 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PlnP61014 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PlnP61014 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PlnP61014 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PlnP61014 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PlnP61014 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PlnP61014 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PlnP61014 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PlnP61014 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PlnP61014 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PlnP61014 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PlnP61014 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PlnP61014 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PlnP61014 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PlnP61014 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PlnP61014 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PlnP61014 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PlnP61014 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PlnP61014 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PlnP61014 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PlnP61014 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PlnP61014 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PlnP61014 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PlnP61014 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PlnP61014 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PlnP61014 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PlnP61014 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PlnP61014 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PlnP61014 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PlnP61014 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PlnP61014 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PlnP61014 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PlnP61014 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PlnP61014 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PlnP61014 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PlnP61014 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PlnP61014 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PlnP61014 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PlnP61014 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PlnP61014 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PlnP61014 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PlnP61014 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PlnP61014 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PlnP61014 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PlnP61014 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PlnP61014 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PlnP61014 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PlnP61014 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PlnP61014 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PlnP61014 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PlnP61014 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PlnP61014 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PlnP61014 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PlnP61014 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PlnP61014 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PlnP61014 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PlnP61014 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PlnP61014 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PlnP61014 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PlnP61014 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PlnP61014 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PlnP61014 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PlnP61014 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PlnP61014 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PlnP61014 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PlnP61014 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PlnP61014 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PlnP61014 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PlnP61014 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PlnP61014 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.6 ms