Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CgnP59242 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CgnP59242 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CgnP59242 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CgnP59242 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CgnP59242 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CgnP59242 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CgnP59242 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CgnP59242 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CgnP59242 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CgnP59242 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CgnP59242 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CgnP59242 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CgnP59242 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
CgnP59242 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CgnP59242 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CgnP59242 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CgnP59242 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CgnP59242 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CgnP59242 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CgnP59242 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CgnP59242 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CgnP59242 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CgnP59242 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CgnP59242 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CgnP59242 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CgnP59242 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CgnP59242 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CgnP59242 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CgnP59242 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CgnP59242 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CgnP59242 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CgnP59242 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CgnP59242 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CgnP59242 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CgnP59242 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CgnP59242 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CgnP59242 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CgnP59242 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CgnP59242 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CgnP59242 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CgnP59242 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CgnP59242 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CgnP59242 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CgnP59242 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CgnP59242 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CgnP59242 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CgnP59242 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CgnP59242 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CgnP59242 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CgnP59242 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CgnP59242 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CgnP59242 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CgnP59242 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CgnP59242 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CgnP59242 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CgnP59242 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CgnP59242 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CgnP59242 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CgnP59242 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CgnP59242 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CgnP59242 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CgnP59242 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CgnP59242 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CgnP59242 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CgnP59242 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CgnP59242 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CgnP59242 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CgnP59242 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CgnP59242 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CgnP59242 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CgnP59242 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CgnP59242 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CgnP59242 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CgnP59242 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CgnP59242 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CgnP59242 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CgnP59242 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CgnP59242 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CgnP59242 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CgnP59242 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CgnP59242 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CgnP59242 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CgnP59242 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CgnP59242 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CgnP59242 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CgnP59242 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CgnP59242 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CgnP59242 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CgnP59242 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CgnP59242 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CgnP59242 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CgnP59242 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CgnP59242 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CgnP59242 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CgnP59242 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CgnP59242 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CgnP59242 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CgnP59242 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CgnP59242 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms