Protein–RNA interactions for Protein: P56657

Cyp2c40, Cytochrome P450 2C40, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c40P56657 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Cyp2c40P56657 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Cyp2c40P56657 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cyp2c40P56657 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Cyp2c40P56657 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Cyp2c40P56657 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cyp2c40P56657 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Cyp2c40P56657 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cyp2c40P56657 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cyp2c40P56657 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cyp2c40P56657 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cyp2c40P56657 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cyp2c40P56657 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cyp2c40P56657 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cyp2c40P56657 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cyp2c40P56657 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cyp2c40P56657 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Cyp2c40P56657 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Cyp2c40P56657 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Cyp2c40P56657 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Cyp2c40P56657 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Cyp2c40P56657 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cyp2c40P56657 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Cyp2c40P56657 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cyp2c40P56657 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cyp2c40P56657 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cyp2c40P56657 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cyp2c40P56657 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Cyp2c40P56657 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cyp2c40P56657 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Cyp2c40P56657 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Cyp2c40P56657 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cyp2c40P56657 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cyp2c40P56657 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cyp2c40P56657 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cyp2c40P56657 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cyp2c40P56657 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cyp2c40P56657 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cyp2c40P56657 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cyp2c40P56657 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Cyp2c40P56657 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cyp2c40P56657 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cyp2c40P56657 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cyp2c40P56657 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cyp2c40P56657 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cyp2c40P56657 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cyp2c40P56657 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cyp2c40P56657 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cyp2c40P56657 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cyp2c40P56657 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cyp2c40P56657 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cyp2c40P56657 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cyp2c40P56657 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cyp2c40P56657 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cyp2c40P56657 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cyp2c40P56657 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cyp2c40P56657 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cyp2c40P56657 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cyp2c40P56657 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cyp2c40P56657 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cyp2c40P56657 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cyp2c40P56657 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cyp2c40P56657 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cyp2c40P56657 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cyp2c40P56657 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cyp2c40P56657 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cyp2c40P56657 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cyp2c40P56657 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cyp2c40P56657 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cyp2c40P56657 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cyp2c40P56657 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cyp2c40P56657 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cyp2c40P56657 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cyp2c40P56657 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cyp2c40P56657 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cyp2c40P56657 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cyp2c40P56657 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Cyp2c40P56657 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cyp2c40P56657 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cyp2c40P56657 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cyp2c40P56657 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cyp2c40P56657 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cyp2c40P56657 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cyp2c40P56657 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cyp2c40P56657 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Cyp2c40P56657 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cyp2c40P56657 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cyp2c40P56657 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cyp2c40P56657 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cyp2c40P56657 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cyp2c40P56657 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cyp2c40P56657 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cyp2c40P56657 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cyp2c40P56657 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Cyp2c40P56657 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Cyp2c40P56657 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cyp2c40P56657 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cyp2c40P56657 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Cyp2c40P56657 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cyp2c40P56657 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms