Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CckbrP56481 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CckbrP56481 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CckbrP56481 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CckbrP56481 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CckbrP56481 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CckbrP56481 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CckbrP56481 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CckbrP56481 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CckbrP56481 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CckbrP56481 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CckbrP56481 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CckbrP56481 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CckbrP56481 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CckbrP56481 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CckbrP56481 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CckbrP56481 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CckbrP56481 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CckbrP56481 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CckbrP56481 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CckbrP56481 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CckbrP56481 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CckbrP56481 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CckbrP56481 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CckbrP56481 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CckbrP56481 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CckbrP56481 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CckbrP56481 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CckbrP56481 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CckbrP56481 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CckbrP56481 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CckbrP56481 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CckbrP56481 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CckbrP56481 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CckbrP56481 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CckbrP56481 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CckbrP56481 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CckbrP56481 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CckbrP56481 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CckbrP56481 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CckbrP56481 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CckbrP56481 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CckbrP56481 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CckbrP56481 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CckbrP56481 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CckbrP56481 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CckbrP56481 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CckbrP56481 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CckbrP56481 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CckbrP56481 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CckbrP56481 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CckbrP56481 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CckbrP56481 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CckbrP56481 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CckbrP56481 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CckbrP56481 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CckbrP56481 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CckbrP56481 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CckbrP56481 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CckbrP56481 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CckbrP56481 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CckbrP56481 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CckbrP56481 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CckbrP56481 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CckbrP56481 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CckbrP56481 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CckbrP56481 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
CckbrP56481 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CckbrP56481 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CckbrP56481 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CckbrP56481 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CckbrP56481 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CckbrP56481 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CckbrP56481 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CckbrP56481 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CckbrP56481 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CckbrP56481 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CckbrP56481 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CckbrP56481 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CckbrP56481 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CckbrP56481 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CckbrP56481 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CckbrP56481 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CckbrP56481 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CckbrP56481 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CckbrP56481 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CckbrP56481 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CckbrP56481 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CckbrP56481 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CckbrP56481 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CckbrP56481 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CckbrP56481 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CckbrP56481 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CckbrP56481 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CckbrP56481 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CckbrP56481 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CckbrP56481 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CckbrP56481 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CckbrP56481 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CckbrP56481 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms