Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gp1bbP56400 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gp1bbP56400 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gp1bbP56400 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gp1bbP56400 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gp1bbP56400 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Gp1bbP56400 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gp1bbP56400 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gp1bbP56400 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gp1bbP56400 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gp1bbP56400 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gp1bbP56400 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gp1bbP56400 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gp1bbP56400 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gp1bbP56400 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gp1bbP56400 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gp1bbP56400 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gp1bbP56400 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gp1bbP56400 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gp1bbP56400 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gp1bbP56400 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gp1bbP56400 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gp1bbP56400 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gp1bbP56400 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gp1bbP56400 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gp1bbP56400 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gp1bbP56400 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gp1bbP56400 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gp1bbP56400 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gp1bbP56400 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gp1bbP56400 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gp1bbP56400 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gp1bbP56400 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gp1bbP56400 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gp1bbP56400 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Gp1bbP56400 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gp1bbP56400 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gp1bbP56400 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gp1bbP56400 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gp1bbP56400 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gp1bbP56400 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gp1bbP56400 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gp1bbP56400 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gp1bbP56400 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gp1bbP56400 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gp1bbP56400 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gp1bbP56400 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Gp1bbP56400 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gp1bbP56400 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gp1bbP56400 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gp1bbP56400 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gp1bbP56400 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gp1bbP56400 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gp1bbP56400 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gp1bbP56400 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Gp1bbP56400 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gp1bbP56400 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gp1bbP56400 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gp1bbP56400 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gp1bbP56400 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gp1bbP56400 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gp1bbP56400 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gp1bbP56400 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gp1bbP56400 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Gp1bbP56400 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Gp1bbP56400 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gp1bbP56400 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gp1bbP56400 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gp1bbP56400 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gp1bbP56400 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gp1bbP56400 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gp1bbP56400 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gp1bbP56400 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gp1bbP56400 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gp1bbP56400 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gp1bbP56400 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gp1bbP56400 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gp1bbP56400 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gp1bbP56400 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gp1bbP56400 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gp1bbP56400 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gp1bbP56400 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gp1bbP56400 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gp1bbP56400 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gp1bbP56400 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gp1bbP56400 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gp1bbP56400 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gp1bbP56400 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gp1bbP56400 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gp1bbP56400 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gp1bbP56400 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gp1bbP56400 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gp1bbP56400 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Gp1bbP56400 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gp1bbP56400 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gp1bbP56400 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gp1bbP56400 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gp1bbP56400 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gp1bbP56400 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gp1bbP56400 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms