Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sh3bp1P55194 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sh3bp1P55194 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sh3bp1P55194 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sh3bp1P55194 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sh3bp1P55194 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sh3bp1P55194 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sh3bp1P55194 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sh3bp1P55194 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sh3bp1P55194 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sh3bp1P55194 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sh3bp1P55194 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sh3bp1P55194 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sh3bp1P55194 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sh3bp1P55194 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sh3bp1P55194 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sh3bp1P55194 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sh3bp1P55194 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sh3bp1P55194 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sh3bp1P55194 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sh3bp1P55194 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sh3bp1P55194 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sh3bp1P55194 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sh3bp1P55194 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sh3bp1P55194 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sh3bp1P55194 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sh3bp1P55194 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sh3bp1P55194 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sh3bp1P55194 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sh3bp1P55194 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sh3bp1P55194 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sh3bp1P55194 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sh3bp1P55194 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sh3bp1P55194 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh3bp1P55194 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh3bp1P55194 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh3bp1P55194 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh3bp1P55194 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh3bp1P55194 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh3bp1P55194 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh3bp1P55194 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh3bp1P55194 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sh3bp1P55194 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sh3bp1P55194 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sh3bp1P55194 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sh3bp1P55194 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sh3bp1P55194 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sh3bp1P55194 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sh3bp1P55194 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Sh3bp1P55194 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Sh3bp1P55194 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sh3bp1P55194 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sh3bp1P55194 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sh3bp1P55194 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sh3bp1P55194 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sh3bp1P55194 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sh3bp1P55194 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sh3bp1P55194 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sh3bp1P55194 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sh3bp1P55194 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sh3bp1P55194 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sh3bp1P55194 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sh3bp1P55194 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Sh3bp1P55194 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sh3bp1P55194 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sh3bp1P55194 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sh3bp1P55194 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sh3bp1P55194 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sh3bp1P55194 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sh3bp1P55194 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sh3bp1P55194 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sh3bp1P55194 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sh3bp1P55194 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sh3bp1P55194 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sh3bp1P55194 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sh3bp1P55194 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sh3bp1P55194 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sh3bp1P55194 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sh3bp1P55194 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sh3bp1P55194 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sh3bp1P55194 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sh3bp1P55194 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sh3bp1P55194 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sh3bp1P55194 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sh3bp1P55194 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sh3bp1P55194 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sh3bp1P55194 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sh3bp1P55194 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sh3bp1P55194 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sh3bp1P55194 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sh3bp1P55194 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sh3bp1P55194 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sh3bp1P55194 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sh3bp1P55194 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sh3bp1P55194 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sh3bp1P55194 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Sh3bp1P55194 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sh3bp1P55194 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sh3bp1P55194 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sh3bp1P55194 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms