Protein–RNA interactions for Protein: P55014

Slc12a1, Solute carrier family 12 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,095 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a1P55014 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc12a1P55014 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc12a1P55014 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc12a1P55014 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Slc12a1P55014 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc12a1P55014 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc12a1P55014 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc12a1P55014 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc12a1P55014 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc12a1P55014 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc12a1P55014 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc12a1P55014 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc12a1P55014 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc12a1P55014 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc12a1P55014 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc12a1P55014 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc12a1P55014 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc12a1P55014 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc12a1P55014 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc12a1P55014 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc12a1P55014 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc12a1P55014 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc12a1P55014 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc12a1P55014 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc12a1P55014 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc12a1P55014 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc12a1P55014 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc12a1P55014 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc12a1P55014 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc12a1P55014 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc12a1P55014 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc12a1P55014 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc12a1P55014 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc12a1P55014 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc12a1P55014 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc12a1P55014 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc12a1P55014 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc12a1P55014 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc12a1P55014 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc12a1P55014 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc12a1P55014 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc12a1P55014 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc12a1P55014 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc12a1P55014 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc12a1P55014 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc12a1P55014 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc12a1P55014 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc12a1P55014 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc12a1P55014 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc12a1P55014 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc12a1P55014 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc12a1P55014 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc12a1P55014 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc12a1P55014 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc12a1P55014 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc12a1P55014 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc12a1P55014 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc12a1P55014 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc12a1P55014 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc12a1P55014 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc12a1P55014 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc12a1P55014 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc12a1P55014 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc12a1P55014 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc12a1P55014 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc12a1P55014 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc12a1P55014 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc12a1P55014 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc12a1P55014 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc12a1P55014 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc12a1P55014 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc12a1P55014 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc12a1P55014 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc12a1P55014 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc12a1P55014 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc12a1P55014 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc12a1P55014 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Slc12a1P55014 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Slc12a1P55014 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Slc12a1P55014 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Slc12a1P55014 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc12a1P55014 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc12a1P55014 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc12a1P55014 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc12a1P55014 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc12a1P55014 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc12a1P55014 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc12a1P55014 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc12a1P55014 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc12a1P55014 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc12a1P55014 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc12a1P55014 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc12a1P55014 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc12a1P55014 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc12a1P55014 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc12a1P55014 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc12a1P55014 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc12a1P55014 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc12a1P55014 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc12a1P55014 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms