Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa6P50704 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa6P50704 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa6P50704 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa6P50704 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa6P50704 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa6P50704 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa6P50704 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa6P50704 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa6P50704 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa6P50704 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa6P50704 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa6P50704 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa6P50704 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa6P50704 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa6P50704 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
Defa6P50704 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa6P50704 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa6P50704 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa6P50704 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa6P50704 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa6P50704 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa6P50704 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa6P50704 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa6P50704 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa6P50704 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa6P50704 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa6P50704 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa6P50704 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa6P50704 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa6P50704 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa6P50704 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa6P50704 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa6P50704 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa6P50704 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa6P50704 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa6P50704 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa6P50704 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa6P50704 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa6P50704 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa6P50704 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa6P50704 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa6P50704 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa6P50704 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa6P50704 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa6P50704 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa6P50704 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa6P50704 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa6P50704 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa6P50704 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa6P50704 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa6P50704 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa6P50704 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Defa6P50704 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Defa6P50704 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Defa6P50704 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa6P50704 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa6P50704 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa6P50704 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa6P50704 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa6P50704 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa6P50704 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa6P50704 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa6P50704 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa6P50704 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa6P50704 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa6P50704 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa6P50704 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa6P50704 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa6P50704 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa6P50704 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa6P50704 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa6P50704 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa6P50704 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa6P50704 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa6P50704 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa6P50704 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa6P50704 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa6P50704 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa6P50704 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa6P50704 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa6P50704 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa6P50704 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa6P50704 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa6P50704 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa6P50704 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa6P50704 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa6P50704 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa6P50704 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa6P50704 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa6P50704 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa6P50704 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa6P50704 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Defa6P50704 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa6P50704 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa6P50704 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa6P50704 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa6P50704 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa6P50704 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa6P50704 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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