Protein–RNA interactions for Protein: P50462

Csrp3, Cysteine and glycine-rich protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrp3P50462 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csrp3P50462 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csrp3P50462 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csrp3P50462 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Csrp3P50462 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Csrp3P50462 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Csrp3P50462 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Csrp3P50462 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Csrp3P50462 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Csrp3P50462 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csrp3P50462 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csrp3P50462 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csrp3P50462 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Csrp3P50462 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Csrp3P50462 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csrp3P50462 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csrp3P50462 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csrp3P50462 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csrp3P50462 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csrp3P50462 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csrp3P50462 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Csrp3P50462 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csrp3P50462 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Csrp3P50462 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csrp3P50462 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csrp3P50462 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Csrp3P50462 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Csrp3P50462 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Csrp3P50462 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Csrp3P50462 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Csrp3P50462 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Csrp3P50462 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csrp3P50462 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csrp3P50462 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csrp3P50462 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Csrp3P50462 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csrp3P50462 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csrp3P50462 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Csrp3P50462 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Csrp3P50462 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Csrp3P50462 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csrp3P50462 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csrp3P50462 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csrp3P50462 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csrp3P50462 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Csrp3P50462 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Csrp3P50462 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Csrp3P50462 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Csrp3P50462 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csrp3P50462 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csrp3P50462 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csrp3P50462 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csrp3P50462 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Csrp3P50462 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Csrp3P50462 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Csrp3P50462 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Csrp3P50462 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Csrp3P50462 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Csrp3P50462 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Csrp3P50462 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Csrp3P50462 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Csrp3P50462 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Csrp3P50462 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Csrp3P50462 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Csrp3P50462 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Csrp3P50462 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Csrp3P50462 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Csrp3P50462 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Csrp3P50462 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Csrp3P50462 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Csrp3P50462 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Csrp3P50462 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Csrp3P50462 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Csrp3P50462 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Csrp3P50462 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Csrp3P50462 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Csrp3P50462 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csrp3P50462 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csrp3P50462 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csrp3P50462 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csrp3P50462 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csrp3P50462 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csrp3P50462 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csrp3P50462 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csrp3P50462 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csrp3P50462 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csrp3P50462 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csrp3P50462 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csrp3P50462 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csrp3P50462 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csrp3P50462 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csrp3P50462 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Csrp3P50462 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Csrp3P50462 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Csrp3P50462 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Csrp3P50462 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Csrp3P50462 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Csrp3P50462 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Csrp3P50462 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Csrp3P50462 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms