Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hoxc13P50207 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hoxc13P50207 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hoxc13P50207 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hoxc13P50207 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hoxc13P50207 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hoxc13P50207 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hoxc13P50207 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hoxc13P50207 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Hoxc13P50207 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hoxc13P50207 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hoxc13P50207 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxc13P50207 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxc13P50207 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxc13P50207 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxc13P50207 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hoxc13P50207 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hoxc13P50207 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hoxc13P50207 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hoxc13P50207 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hoxc13P50207 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hoxc13P50207 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hoxc13P50207 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hoxc13P50207 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hoxc13P50207 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hoxc13P50207 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hoxc13P50207 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxc13P50207 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxc13P50207 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxc13P50207 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hoxc13P50207 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hoxc13P50207 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Hoxc13P50207 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Hoxc13P50207 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hoxc13P50207 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hoxc13P50207 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxc13P50207 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxc13P50207 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxc13P50207 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxc13P50207 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxc13P50207 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxc13P50207 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxc13P50207 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxc13P50207 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxc13P50207 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxc13P50207 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxc13P50207 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxc13P50207 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxc13P50207 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxc13P50207 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxc13P50207 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxc13P50207 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxc13P50207 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxc13P50207 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxc13P50207 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxc13P50207 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hoxc13P50207 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hoxc13P50207 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hoxc13P50207 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hoxc13P50207 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hoxc13P50207 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Hoxc13P50207 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Hoxc13P50207 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hoxc13P50207 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hoxc13P50207 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hoxc13P50207 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hoxc13P50207 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hoxc13P50207 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hoxc13P50207 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hoxc13P50207 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hoxc13P50207 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxc13P50207 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxc13P50207 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxc13P50207 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxc13P50207 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxc13P50207 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxc13P50207 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxc13P50207 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxc13P50207 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxc13P50207 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxc13P50207 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hoxc13P50207 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hoxc13P50207 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hoxc13P50207 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hoxc13P50207 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hoxc13P50207 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hoxc13P50207 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hoxc13P50207 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hoxc13P50207 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hoxc13P50207 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hoxc13P50207 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxc13P50207 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxc13P50207 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxc13P50207 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxc13P50207 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxc13P50207 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxc13P50207 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxc13P50207 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxc13P50207 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxc13P50207 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms