Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Psen1P49769 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Psen1P49769 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psen1P49769 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psen1P49769 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psen1P49769 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psen1P49769 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psen1P49769 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Psen1P49769 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psen1P49769 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psen1P49769 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psen1P49769 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psen1P49769 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psen1P49769 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psen1P49769 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psen1P49769 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psen1P49769 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psen1P49769 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psen1P49769 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psen1P49769 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psen1P49769 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psen1P49769 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psen1P49769 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Psen1P49769 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psen1P49769 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psen1P49769 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psen1P49769 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psen1P49769 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psen1P49769 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psen1P49769 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Psen1P49769 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Psen1P49769 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Psen1P49769 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Psen1P49769 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Psen1P49769 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Psen1P49769 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Psen1P49769 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psen1P49769 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psen1P49769 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psen1P49769 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psen1P49769 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psen1P49769 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psen1P49769 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psen1P49769 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psen1P49769 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Psen1P49769 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psen1P49769 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psen1P49769 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psen1P49769 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psen1P49769 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psen1P49769 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psen1P49769 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psen1P49769 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psen1P49769 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psen1P49769 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psen1P49769 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Psen1P49769 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psen1P49769 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psen1P49769 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psen1P49769 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psen1P49769 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psen1P49769 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psen1P49769 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psen1P49769 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Psen1P49769 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psen1P49769 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psen1P49769 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psen1P49769 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psen1P49769 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psen1P49769 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psen1P49769 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psen1P49769 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psen1P49769 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psen1P49769 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psen1P49769 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psen1P49769 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psen1P49769 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psen1P49769 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psen1P49769 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psen1P49769 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psen1P49769 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psen1P49769 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psen1P49769 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psen1P49769 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psen1P49769 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psen1P49769 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psen1P49769 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psen1P49769 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Psen1P49769 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psen1P49769 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psen1P49769 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psen1P49769 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Psen1P49769 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Psen1P49769 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Psen1P49769 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Psen1P49769 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psen1P49769 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psen1P49769 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psen1P49769 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psen1P49769 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms