Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rpl13P47963 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Rpl13P47963 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rpl13P47963 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rpl13P47963 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rpl13P47963 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rpl13P47963 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rpl13P47963 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpl13P47963 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpl13P47963 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpl13P47963 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpl13P47963 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpl13P47963 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rpl13P47963 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rpl13P47963 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Rpl13P47963 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rpl13P47963 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rpl13P47963 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rpl13P47963 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rpl13P47963 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rpl13P47963 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rpl13P47963 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rpl13P47963 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rpl13P47963 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rpl13P47963 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rpl13P47963 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rpl13P47963 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rpl13P47963 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rpl13P47963 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rpl13P47963 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rpl13P47963 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rpl13P47963 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rpl13P47963 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rpl13P47963 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rpl13P47963 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rpl13P47963 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rpl13P47963 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rpl13P47963 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rpl13P47963 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rpl13P47963 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rpl13P47963 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rpl13P47963 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rpl13P47963 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rpl13P47963 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rpl13P47963 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rpl13P47963 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rpl13P47963 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rpl13P47963 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rpl13P47963 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rpl13P47963 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rpl13P47963 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rpl13P47963 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rpl13P47963 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rpl13P47963 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rpl13P47963 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rpl13P47963 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rpl13P47963 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Rpl13P47963 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Rpl13P47963 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rpl13P47963 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpl13P47963 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpl13P47963 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpl13P47963 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpl13P47963 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpl13P47963 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpl13P47963 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpl13P47963 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpl13P47963 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpl13P47963 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpl13P47963 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpl13P47963 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpl13P47963 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpl13P47963 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpl13P47963 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpl13P47963 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpl13P47963 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpl13P47963 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpl13P47963 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpl13P47963 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpl13P47963 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpl13P47963 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpl13P47963 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpl13P47963 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rpl13P47963 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rpl13P47963 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rpl13P47963 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Rpl13P47963 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rpl13P47963 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rpl13P47963 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rpl13P47963 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rpl13P47963 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rpl13P47963 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rpl13P47963 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rpl13P47963 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rpl13P47963 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rpl13P47963 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Rpl13P47963 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Rpl13P47963 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rpl13P47963 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rpl13P47963 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms