Protein–RNA interactions for Protein: P46460

Nsf, Vesicle-fusing ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsfP46460 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NsfP46460 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NsfP46460 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NsfP46460 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NsfP46460 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NsfP46460 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NsfP46460 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NsfP46460 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NsfP46460 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NsfP46460 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NsfP46460 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NsfP46460 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NsfP46460 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NsfP46460 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NsfP46460 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NsfP46460 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NsfP46460 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NsfP46460 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NsfP46460 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NsfP46460 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NsfP46460 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NsfP46460 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NsfP46460 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NsfP46460 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NsfP46460 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NsfP46460 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NsfP46460 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NsfP46460 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NsfP46460 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NsfP46460 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NsfP46460 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NsfP46460 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NsfP46460 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NsfP46460 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NsfP46460 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NsfP46460 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NsfP46460 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NsfP46460 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NsfP46460 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NsfP46460 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NsfP46460 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NsfP46460 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NsfP46460 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NsfP46460 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NsfP46460 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
NsfP46460 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NsfP46460 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NsfP46460 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NsfP46460 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NsfP46460 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NsfP46460 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NsfP46460 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NsfP46460 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NsfP46460 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NsfP46460 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NsfP46460 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NsfP46460 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NsfP46460 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NsfP46460 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NsfP46460 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NsfP46460 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NsfP46460 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NsfP46460 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NsfP46460 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NsfP46460 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NsfP46460 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NsfP46460 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NsfP46460 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NsfP46460 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NsfP46460 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NsfP46460 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NsfP46460 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NsfP46460 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NsfP46460 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NsfP46460 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NsfP46460 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NsfP46460 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NsfP46460 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NsfP46460 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NsfP46460 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NsfP46460 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NsfP46460 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NsfP46460 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NsfP46460 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NsfP46460 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NsfP46460 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NsfP46460 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NsfP46460 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NsfP46460 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NsfP46460 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NsfP46460 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NsfP46460 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NsfP46460 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NsfP46460 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NsfP46460 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NsfP46460 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NsfP46460 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NsfP46460 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NsfP46460 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NsfP46460 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.2 ms