Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Klf1P46099 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klf1P46099 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klf1P46099 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klf1P46099 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klf1P46099 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klf1P46099 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klf1P46099 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klf1P46099 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klf1P46099 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klf1P46099 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klf1P46099 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klf1P46099 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klf1P46099 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klf1P46099 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klf1P46099 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klf1P46099 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klf1P46099 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klf1P46099 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klf1P46099 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klf1P46099 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klf1P46099 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klf1P46099 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Klf1P46099 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Klf1P46099 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Klf1P46099 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Klf1P46099 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Klf1P46099 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Klf1P46099 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Klf1P46099 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Klf1P46099 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Klf1P46099 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Klf1P46099 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Klf1P46099 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Klf1P46099 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Klf1P46099 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Klf1P46099 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Klf1P46099 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Klf1P46099 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Klf1P46099 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Klf1P46099 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Klf1P46099 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Klf1P46099 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Klf1P46099 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Klf1P46099 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Klf1P46099 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Klf1P46099 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Klf1P46099 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Klf1P46099 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Klf1P46099 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Klf1P46099 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klf1P46099 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klf1P46099 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klf1P46099 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klf1P46099 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klf1P46099 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Klf1P46099 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klf1P46099 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Klf1P46099 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Klf1P46099 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Klf1P46099 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Klf1P46099 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Klf1P46099 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Klf1P46099 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Klf1P46099 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Klf1P46099 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klf1P46099 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klf1P46099 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klf1P46099 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klf1P46099 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klf1P46099 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Klf1P46099 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klf1P46099 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klf1P46099 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klf1P46099 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Klf1P46099 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Klf1P46099 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Klf1P46099 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Klf1P46099 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Klf1P46099 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Klf1P46099 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Klf1P46099 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Klf1P46099 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Klf1P46099 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Klf1P46099 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Klf1P46099 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Klf1P46099 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Klf1P46099 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Klf1P46099 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Klf1P46099 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Klf1P46099 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Klf1P46099 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Klf1P46099 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Klf1P46099 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Klf1P46099 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Klf1P46099 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Klf1P46099 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Klf1P46099 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klf1P46099 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klf1P46099 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms