Protein–RNA interactions for Protein: P41731

Cd63, CD63 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd63P41731 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd63P41731 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd63P41731 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd63P41731 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd63P41731 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd63P41731 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd63P41731 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd63P41731 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd63P41731 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd63P41731 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd63P41731 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd63P41731 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd63P41731 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd63P41731 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd63P41731 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd63P41731 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd63P41731 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd63P41731 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd63P41731 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd63P41731 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd63P41731 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd63P41731 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd63P41731 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd63P41731 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd63P41731 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd63P41731 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd63P41731 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd63P41731 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd63P41731 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd63P41731 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd63P41731 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd63P41731 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd63P41731 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd63P41731 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd63P41731 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd63P41731 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd63P41731 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd63P41731 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd63P41731 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd63P41731 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd63P41731 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd63P41731 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd63P41731 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd63P41731 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd63P41731 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd63P41731 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd63P41731 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cd63P41731 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cd63P41731 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cd63P41731 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cd63P41731 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cd63P41731 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd63P41731 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd63P41731 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd63P41731 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd63P41731 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd63P41731 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd63P41731 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd63P41731 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd63P41731 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd63P41731 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd63P41731 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd63P41731 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd63P41731 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd63P41731 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd63P41731 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd63P41731 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd63P41731 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd63P41731 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd63P41731 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd63P41731 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd63P41731 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd63P41731 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cd63P41731 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cd63P41731 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cd63P41731 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cd63P41731 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cd63P41731 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd63P41731 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd63P41731 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd63P41731 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd63P41731 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd63P41731 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd63P41731 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd63P41731 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd63P41731 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd63P41731 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd63P41731 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd63P41731 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd63P41731 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd63P41731 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd63P41731 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd63P41731 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd63P41731 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd63P41731 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd63P41731 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd63P41731 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd63P41731 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd63P41731 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd63P41731 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms