Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl28P41105 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl28P41105 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl28P41105 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl28P41105 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl28P41105 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl28P41105 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl28P41105 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl28P41105 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl28P41105 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl28P41105 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl28P41105 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl28P41105 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl28P41105 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl28P41105 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl28P41105 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl28P41105 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl28P41105 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl28P41105 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl28P41105 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl28P41105 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl28P41105 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl28P41105 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl28P41105 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl28P41105 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl28P41105 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl28P41105 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl28P41105 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl28P41105 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl28P41105 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl28P41105 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl28P41105 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl28P41105 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl28P41105 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl28P41105 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl28P41105 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl28P41105 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl28P41105 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl28P41105 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl28P41105 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl28P41105 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl28P41105 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl28P41105 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl28P41105 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl28P41105 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl28P41105 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl28P41105 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl28P41105 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl28P41105 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl28P41105 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl28P41105 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl28P41105 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rpl28P41105 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rpl28P41105 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpl28P41105 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpl28P41105 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpl28P41105 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpl28P41105 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpl28P41105 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpl28P41105 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpl28P41105 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpl28P41105 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpl28P41105 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpl28P41105 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpl28P41105 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpl28P41105 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl28P41105 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl28P41105 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl28P41105 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl28P41105 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpl28P41105 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpl28P41105 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpl28P41105 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpl28P41105 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpl28P41105 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpl28P41105 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpl28P41105 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpl28P41105 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpl28P41105 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpl28P41105 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl28P41105 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl28P41105 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl28P41105 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl28P41105 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl28P41105 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl28P41105 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl28P41105 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl28P41105 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl28P41105 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl28P41105 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpl28P41105 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpl28P41105 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpl28P41105 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpl28P41105 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpl28P41105 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpl28P41105 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpl28P41105 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpl28P41105 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpl28P41105 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpl28P41105 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms