Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TfamP40630 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TfamP40630 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TfamP40630 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TfamP40630 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TfamP40630 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TfamP40630 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TfamP40630 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TfamP40630 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TfamP40630 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TfamP40630 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TfamP40630 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TfamP40630 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TfamP40630 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TfamP40630 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TfamP40630 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TfamP40630 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TfamP40630 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TfamP40630 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TfamP40630 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TfamP40630 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TfamP40630 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TfamP40630 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TfamP40630 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TfamP40630 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TfamP40630 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TfamP40630 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TfamP40630 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TfamP40630 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TfamP40630 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TfamP40630 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TfamP40630 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TfamP40630 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TfamP40630 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TfamP40630 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TfamP40630 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TfamP40630 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TfamP40630 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TfamP40630 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TfamP40630 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TfamP40630 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TfamP40630 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TfamP40630 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TfamP40630 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TfamP40630 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TfamP40630 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TfamP40630 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TfamP40630 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TfamP40630 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TfamP40630 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TfamP40630 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TfamP40630 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TfamP40630 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TfamP40630 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TfamP40630 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TfamP40630 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TfamP40630 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TfamP40630 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TfamP40630 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TfamP40630 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TfamP40630 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TfamP40630 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TfamP40630 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TfamP40630 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TfamP40630 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TfamP40630 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TfamP40630 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TfamP40630 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TfamP40630 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TfamP40630 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TfamP40630 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TfamP40630 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TfamP40630 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TfamP40630 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TfamP40630 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TfamP40630 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TfamP40630 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TfamP40630 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TfamP40630 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TfamP40630 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TfamP40630 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TfamP40630 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TfamP40630 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TfamP40630 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TfamP40630 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TfamP40630 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TfamP40630 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TfamP40630 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TfamP40630 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TfamP40630 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TfamP40630 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TfamP40630 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TfamP40630 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TfamP40630 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TfamP40630 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TfamP40630 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TfamP40630 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TfamP40630 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TfamP40630 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TfamP40630 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms