Protein–RNA interactions for Protein: P40336

Vps26a, Vacuolar protein sorting-associated protein 26A, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps26aP40336 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vps26aP40336 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vps26aP40336 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vps26aP40336 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vps26aP40336 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vps26aP40336 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vps26aP40336 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vps26aP40336 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vps26aP40336 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vps26aP40336 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vps26aP40336 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vps26aP40336 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vps26aP40336 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vps26aP40336 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vps26aP40336 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vps26aP40336 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vps26aP40336 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vps26aP40336 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vps26aP40336 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vps26aP40336 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vps26aP40336 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vps26aP40336 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vps26aP40336 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Vps26aP40336 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vps26aP40336 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vps26aP40336 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vps26aP40336 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vps26aP40336 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vps26aP40336 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vps26aP40336 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vps26aP40336 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vps26aP40336 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vps26aP40336 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vps26aP40336 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vps26aP40336 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vps26aP40336 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vps26aP40336 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vps26aP40336 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vps26aP40336 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vps26aP40336 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vps26aP40336 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vps26aP40336 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vps26aP40336 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vps26aP40336 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vps26aP40336 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vps26aP40336 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vps26aP40336 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vps26aP40336 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vps26aP40336 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vps26aP40336 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vps26aP40336 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vps26aP40336 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vps26aP40336 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vps26aP40336 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vps26aP40336 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vps26aP40336 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vps26aP40336 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vps26aP40336 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vps26aP40336 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vps26aP40336 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vps26aP40336 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Vps26aP40336 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vps26aP40336 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vps26aP40336 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vps26aP40336 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vps26aP40336 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Vps26aP40336 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Vps26aP40336 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vps26aP40336 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vps26aP40336 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vps26aP40336 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vps26aP40336 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vps26aP40336 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vps26aP40336 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vps26aP40336 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Vps26aP40336 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vps26aP40336 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vps26aP40336 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vps26aP40336 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vps26aP40336 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vps26aP40336 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vps26aP40336 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vps26aP40336 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vps26aP40336 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vps26aP40336 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vps26aP40336 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vps26aP40336 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vps26aP40336 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vps26aP40336 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vps26aP40336 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vps26aP40336 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vps26aP40336 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vps26aP40336 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vps26aP40336 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vps26aP40336 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vps26aP40336 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vps26aP40336 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Vps26aP40336 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Vps26aP40336 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vps26aP40336 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms