Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ThpoP40226 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ThpoP40226 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ThpoP40226 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ThpoP40226 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ThpoP40226 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ThpoP40226 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ThpoP40226 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ThpoP40226 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ThpoP40226 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ThpoP40226 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ThpoP40226 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ThpoP40226 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ThpoP40226 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ThpoP40226 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ThpoP40226 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ThpoP40226 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ThpoP40226 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ThpoP40226 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ThpoP40226 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ThpoP40226 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ThpoP40226 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ThpoP40226 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ThpoP40226 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ThpoP40226 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ThpoP40226 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ThpoP40226 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ThpoP40226 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ThpoP40226 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ThpoP40226 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ThpoP40226 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ThpoP40226 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ThpoP40226 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ThpoP40226 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ThpoP40226 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ThpoP40226 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ThpoP40226 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ThpoP40226 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ThpoP40226 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ThpoP40226 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ThpoP40226 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ThpoP40226 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ThpoP40226 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ThpoP40226 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ThpoP40226 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ThpoP40226 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ThpoP40226 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ThpoP40226 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ThpoP40226 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ThpoP40226 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ThpoP40226 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ThpoP40226 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ThpoP40226 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ThpoP40226 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ThpoP40226 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ThpoP40226 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ThpoP40226 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ThpoP40226 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ThpoP40226 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ThpoP40226 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ThpoP40226 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ThpoP40226 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ThpoP40226 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ThpoP40226 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ThpoP40226 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ThpoP40226 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ThpoP40226 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ThpoP40226 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ThpoP40226 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ThpoP40226 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ThpoP40226 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ThpoP40226 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ThpoP40226 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ThpoP40226 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ThpoP40226 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ThpoP40226 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ThpoP40226 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ThpoP40226 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ThpoP40226 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ThpoP40226 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ThpoP40226 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ThpoP40226 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ThpoP40226 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ThpoP40226 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ThpoP40226 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ThpoP40226 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ThpoP40226 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ThpoP40226 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ThpoP40226 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ThpoP40226 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ThpoP40226 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ThpoP40226 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ThpoP40226 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ThpoP40226 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ThpoP40226 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ThpoP40226 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ThpoP40226 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ThpoP40226 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ThpoP40226 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ThpoP40226 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms