Protein–RNA interactions for Protein: P35922

Fmr1, Synaptic functional regulator FMR1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmr1P35922 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fmr1P35922 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fmr1P35922 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fmr1P35922 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fmr1P35922 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fmr1P35922 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fmr1P35922 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fmr1P35922 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fmr1P35922 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fmr1P35922 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fmr1P35922 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fmr1P35922 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fmr1P35922 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Fmr1P35922 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fmr1P35922 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fmr1P35922 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fmr1P35922 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fmr1P35922 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fmr1P35922 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fmr1P35922 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fmr1P35922 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fmr1P35922 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fmr1P35922 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fmr1P35922 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fmr1P35922 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fmr1P35922 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fmr1P35922 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fmr1P35922 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fmr1P35922 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fmr1P35922 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fmr1P35922 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Fmr1P35922 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fmr1P35922 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fmr1P35922 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fmr1P35922 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fmr1P35922 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fmr1P35922 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fmr1P35922 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fmr1P35922 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Fmr1P35922 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fmr1P35922 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Fmr1P35922 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fmr1P35922 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fmr1P35922 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fmr1P35922 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fmr1P35922 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fmr1P35922 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fmr1P35922 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fmr1P35922 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fmr1P35922 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fmr1P35922 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fmr1P35922 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fmr1P35922 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fmr1P35922 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fmr1P35922 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fmr1P35922 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fmr1P35922 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fmr1P35922 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fmr1P35922 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fmr1P35922 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fmr1P35922 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fmr1P35922 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fmr1P35922 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fmr1P35922 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Fmr1P35922 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fmr1P35922 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fmr1P35922 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fmr1P35922 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Fmr1P35922 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fmr1P35922 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fmr1P35922 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fmr1P35922 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fmr1P35922 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fmr1P35922 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fmr1P35922 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fmr1P35922 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fmr1P35922 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fmr1P35922 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fmr1P35922 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fmr1P35922 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fmr1P35922 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fmr1P35922 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fmr1P35922 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fmr1P35922 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fmr1P35922 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fmr1P35922 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fmr1P35922 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fmr1P35922 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fmr1P35922 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fmr1P35922 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fmr1P35922 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fmr1P35922 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fmr1P35922 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fmr1P35922 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fmr1P35922 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fmr1P35922 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fmr1P35922 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fmr1P35922 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fmr1P35922 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fmr1P35922 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.8 ms