Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ctnnd1P30999 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ctnnd1P30999 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ctnnd1P30999 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ctnnd1P30999 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ctnnd1P30999 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ctnnd1P30999 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ctnnd1P30999 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ctnnd1P30999 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ctnnd1P30999 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ctnnd1P30999 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ctnnd1P30999 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ctnnd1P30999 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ctnnd1P30999 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ctnnd1P30999 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ctnnd1P30999 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctnnd1P30999 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctnnd1P30999 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctnnd1P30999 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctnnd1P30999 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctnnd1P30999 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctnnd1P30999 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctnnd1P30999 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctnnd1P30999 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctnnd1P30999 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ctnnd1P30999 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ctnnd1P30999 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ctnnd1P30999 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ctnnd1P30999 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ctnnd1P30999 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ctnnd1P30999 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ctnnd1P30999 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ctnnd1P30999 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ctnnd1P30999 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ctnnd1P30999 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ctnnd1P30999 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ctnnd1P30999 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ctnnd1P30999 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ctnnd1P30999 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ctnnd1P30999 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ctnnd1P30999 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ctnnd1P30999 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ctnnd1P30999 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ctnnd1P30999 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ctnnd1P30999 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ctnnd1P30999 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ctnnd1P30999 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ctnnd1P30999 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ctnnd1P30999 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ctnnd1P30999 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ctnnd1P30999 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ctnnd1P30999 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ctnnd1P30999 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctnnd1P30999 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctnnd1P30999 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctnnd1P30999 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctnnd1P30999 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctnnd1P30999 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctnnd1P30999 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctnnd1P30999 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ctnnd1P30999 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ctnnd1P30999 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ctnnd1P30999 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ctnnd1P30999 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ctnnd1P30999 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ctnnd1P30999 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ctnnd1P30999 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ctnnd1P30999 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ctnnd1P30999 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ctnnd1P30999 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ctnnd1P30999 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ctnnd1P30999 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ctnnd1P30999 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ctnnd1P30999 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ctnnd1P30999 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ctnnd1P30999 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ctnnd1P30999 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ctnnd1P30999 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ctnnd1P30999 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ctnnd1P30999 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ctnnd1P30999 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ctnnd1P30999 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ctnnd1P30999 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ctnnd1P30999 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ctnnd1P30999 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ctnnd1P30999 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ctnnd1P30999 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ctnnd1P30999 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ctnnd1P30999 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ctnnd1P30999 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ctnnd1P30999 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ctnnd1P30999 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ctnnd1P30999 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ctnnd1P30999 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ctnnd1P30999 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ctnnd1P30999 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ctnnd1P30999 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ctnnd1P30999 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ctnnd1P30999 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ctnnd1P30999 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms