Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Casp1P29452 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Casp1P29452 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Casp1P29452 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Casp1P29452 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Casp1P29452 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Casp1P29452 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Casp1P29452 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Casp1P29452 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Casp1P29452 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Casp1P29452 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Casp1P29452 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Casp1P29452 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Casp1P29452 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Casp1P29452 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Casp1P29452 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Casp1P29452 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Casp1P29452 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Casp1P29452 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Casp1P29452 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Casp1P29452 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Casp1P29452 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Casp1P29452 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Casp1P29452 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Casp1P29452 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Casp1P29452 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Casp1P29452 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Casp1P29452 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Casp1P29452 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Casp1P29452 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Casp1P29452 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Casp1P29452 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Casp1P29452 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Casp1P29452 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Casp1P29452 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Casp1P29452 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Casp1P29452 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Casp1P29452 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Casp1P29452 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Casp1P29452 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Casp1P29452 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Casp1P29452 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Casp1P29452 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Casp1P29452 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Casp1P29452 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Casp1P29452 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Casp1P29452 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Casp1P29452 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Casp1P29452 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Casp1P29452 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Casp1P29452 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Casp1P29452 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Casp1P29452 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Casp1P29452 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Casp1P29452 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Casp1P29452 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Casp1P29452 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Casp1P29452 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Casp1P29452 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Casp1P29452 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Casp1P29452 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Casp1P29452 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Casp1P29452 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Casp1P29452 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Casp1P29452 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Casp1P29452 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Casp1P29452 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Casp1P29452 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Casp1P29452 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Casp1P29452 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Casp1P29452 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Casp1P29452 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Casp1P29452 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Casp1P29452 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Casp1P29452 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Casp1P29452 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Casp1P29452 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Casp1P29452 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Casp1P29452 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Casp1P29452 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Casp1P29452 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Casp1P29452 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Casp1P29452 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Casp1P29452 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Casp1P29452 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Casp1P29452 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Casp1P29452 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Casp1P29452 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Casp1P29452 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Casp1P29452 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Casp1P29452 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Casp1P29452 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Casp1P29452 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Casp1P29452 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Casp1P29452 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Casp1P29452 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Casp1P29452 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Casp1P29452 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Casp1P29452 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Casp1P29452 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms