Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NapbP28663 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NapbP28663 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NapbP28663 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NapbP28663 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NapbP28663 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NapbP28663 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NapbP28663 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NapbP28663 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NapbP28663 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NapbP28663 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NapbP28663 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NapbP28663 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NapbP28663 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NapbP28663 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NapbP28663 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NapbP28663 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NapbP28663 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NapbP28663 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NapbP28663 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NapbP28663 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NapbP28663 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NapbP28663 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NapbP28663 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NapbP28663 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NapbP28663 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NapbP28663 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NapbP28663 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NapbP28663 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NapbP28663 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NapbP28663 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NapbP28663 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NapbP28663 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NapbP28663 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NapbP28663 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NapbP28663 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NapbP28663 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NapbP28663 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NapbP28663 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NapbP28663 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NapbP28663 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NapbP28663 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NapbP28663 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NapbP28663 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NapbP28663 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NapbP28663 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NapbP28663 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NapbP28663 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NapbP28663 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NapbP28663 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NapbP28663 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NapbP28663 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NapbP28663 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NapbP28663 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NapbP28663 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NapbP28663 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NapbP28663 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NapbP28663 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NapbP28663 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NapbP28663 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NapbP28663 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NapbP28663 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NapbP28663 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NapbP28663 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
NapbP28663 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NapbP28663 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NapbP28663 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NapbP28663 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NapbP28663 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NapbP28663 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NapbP28663 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NapbP28663 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NapbP28663 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NapbP28663 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NapbP28663 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NapbP28663 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NapbP28663 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NapbP28663 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NapbP28663 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NapbP28663 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NapbP28663 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NapbP28663 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NapbP28663 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NapbP28663 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NapbP28663 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NapbP28663 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NapbP28663 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NapbP28663 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NapbP28663 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NapbP28663 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NapbP28663 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NapbP28663 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NapbP28663 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NapbP28663 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NapbP28663 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NapbP28663 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NapbP28663 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NapbP28663 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NapbP28663 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NapbP28663 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms