Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa2P28309 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa2P28309 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa2P28309 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa2P28309 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa2P28309 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa2P28309 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa2P28309 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa2P28309 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa2P28309 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa2P28309 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa2P28309 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa2P28309 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa2P28309 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa2P28309 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa2P28309 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa2P28309 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa2P28309 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa2P28309 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa2P28309 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa2P28309 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa2P28309 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa2P28309 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa2P28309 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa2P28309 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa2P28309 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa2P28309 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa2P28309 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa2P28309 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa2P28309 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa2P28309 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa2P28309 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa2P28309 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa2P28309 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa2P28309 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa2P28309 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa2P28309 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa2P28309 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa2P28309 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa2P28309 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa2P28309 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa2P28309 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa2P28309 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa2P28309 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa2P28309 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Defa2P28309 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Defa2P28309 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Defa2P28309 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa2P28309 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa2P28309 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa2P28309 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa2P28309 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa2P28309 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa2P28309 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa2P28309 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa2P28309 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa2P28309 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa2P28309 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa2P28309 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa2P28309 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa2P28309 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa2P28309 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa2P28309 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa2P28309 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa2P28309 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa2P28309 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa2P28309 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa2P28309 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa2P28309 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa2P28309 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa2P28309 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa2P28309 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa2P28309 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa2P28309 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa2P28309 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa2P28309 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa2P28309 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa2P28309 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa2P28309 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa2P28309 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa2P28309 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa2P28309 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa2P28309 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa2P28309 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa2P28309 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa2P28309 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa2P28309 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa2P28309 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa2P28309 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa2P28309 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa2P28309 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa2P28309 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa2P28309 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Defa2P28309 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa2P28309 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa2P28309 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa2P28309 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa2P28309 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa2P28309 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa2P28309 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms