Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Psmb9P28076 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Psmb9P28076 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Psmb9P28076 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Psmb9P28076 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Psmb9P28076 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Psmb9P28076 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Psmb9P28076 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Psmb9P28076 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Psmb9P28076 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Psmb9P28076 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Psmb9P28076 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Psmb9P28076 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Psmb9P28076 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Psmb9P28076 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Psmb9P28076 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Psmb9P28076 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Psmb9P28076 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Psmb9P28076 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Psmb9P28076 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Psmb9P28076 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Psmb9P28076 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Psmb9P28076 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Psmb9P28076 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Psmb9P28076 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Psmb9P28076 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Psmb9P28076 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Psmb9P28076 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Psmb9P28076 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Psmb9P28076 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Psmb9P28076 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Psmb9P28076 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Psmb9P28076 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Psmb9P28076 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Psmb9P28076 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Psmb9P28076 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Psmb9P28076 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Psmb9P28076 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Psmb9P28076 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Psmb9P28076 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Psmb9P28076 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Psmb9P28076 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Psmb9P28076 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Psmb9P28076 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Psmb9P28076 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Psmb9P28076 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psmb9P28076 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psmb9P28076 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psmb9P28076 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Psmb9P28076 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Psmb9P28076 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Psmb9P28076 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Psmb9P28076 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Psmb9P28076 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Psmb9P28076 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Psmb9P28076 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Psmb9P28076 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Psmb9P28076 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Psmb9P28076 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psmb9P28076 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psmb9P28076 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psmb9P28076 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psmb9P28076 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psmb9P28076 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psmb9P28076 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psmb9P28076 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psmb9P28076 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psmb9P28076 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psmb9P28076 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psmb9P28076 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Psmb9P28076 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Psmb9P28076 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Psmb9P28076 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Psmb9P28076 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Psmb9P28076 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Psmb9P28076 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Psmb9P28076 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Psmb9P28076 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psmb9P28076 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psmb9P28076 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Psmb9P28076 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Psmb9P28076 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psmb9P28076 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psmb9P28076 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psmb9P28076 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psmb9P28076 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psmb9P28076 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psmb9P28076 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psmb9P28076 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psmb9P28076 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psmb9P28076 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psmb9P28076 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psmb9P28076 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psmb9P28076 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psmb9P28076 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psmb9P28076 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Psmb9P28076 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Psmb9P28076 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Psmb9P28076 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Psmb9P28076 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms