Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NdnP25233 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NdnP25233 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NdnP25233 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NdnP25233 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NdnP25233 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NdnP25233 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NdnP25233 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NdnP25233 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NdnP25233 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NdnP25233 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NdnP25233 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NdnP25233 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NdnP25233 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NdnP25233 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NdnP25233 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NdnP25233 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NdnP25233 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NdnP25233 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NdnP25233 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NdnP25233 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NdnP25233 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NdnP25233 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NdnP25233 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NdnP25233 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NdnP25233 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NdnP25233 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NdnP25233 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NdnP25233 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NdnP25233 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NdnP25233 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NdnP25233 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NdnP25233 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NdnP25233 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NdnP25233 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NdnP25233 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NdnP25233 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NdnP25233 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NdnP25233 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NdnP25233 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NdnP25233 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NdnP25233 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NdnP25233 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NdnP25233 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NdnP25233 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NdnP25233 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NdnP25233 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
NdnP25233 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NdnP25233 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NdnP25233 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NdnP25233 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NdnP25233 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NdnP25233 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NdnP25233 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NdnP25233 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NdnP25233 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NdnP25233 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NdnP25233 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NdnP25233 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NdnP25233 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NdnP25233 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NdnP25233 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NdnP25233 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NdnP25233 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NdnP25233 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NdnP25233 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NdnP25233 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NdnP25233 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NdnP25233 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NdnP25233 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NdnP25233 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NdnP25233 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NdnP25233 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NdnP25233 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NdnP25233 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NdnP25233 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NdnP25233 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NdnP25233 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NdnP25233 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NdnP25233 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NdnP25233 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NdnP25233 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NdnP25233 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NdnP25233 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NdnP25233 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NdnP25233 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NdnP25233 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NdnP25233 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NdnP25233 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NdnP25233 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NdnP25233 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NdnP25233 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NdnP25233 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NdnP25233 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NdnP25233 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NdnP25233 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NdnP25233 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NdnP25233 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NdnP25233 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NdnP25233 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms