Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tsta3P23591 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tsta3P23591 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tsta3P23591 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tsta3P23591 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tsta3P23591 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tsta3P23591 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tsta3P23591 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tsta3P23591 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tsta3P23591 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Tsta3P23591 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tsta3P23591 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tsta3P23591 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tsta3P23591 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tsta3P23591 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tsta3P23591 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tsta3P23591 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tsta3P23591 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tsta3P23591 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Tsta3P23591 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tsta3P23591 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tsta3P23591 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tsta3P23591 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tsta3P23591 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tsta3P23591 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tsta3P23591 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tsta3P23591 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tsta3P23591 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tsta3P23591 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tsta3P23591 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tsta3P23591 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tsta3P23591 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tsta3P23591 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tsta3P23591 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tsta3P23591 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tsta3P23591 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tsta3P23591 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tsta3P23591 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tsta3P23591 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tsta3P23591 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tsta3P23591 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tsta3P23591 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tsta3P23591 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tsta3P23591 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tsta3P23591 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tsta3P23591 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tsta3P23591 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tsta3P23591 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tsta3P23591 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tsta3P23591 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tsta3P23591 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tsta3P23591 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tsta3P23591 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tsta3P23591 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tsta3P23591 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tsta3P23591 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tsta3P23591 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tsta3P23591 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tsta3P23591 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tsta3P23591 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tsta3P23591 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tsta3P23591 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tsta3P23591 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tsta3P23591 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tsta3P23591 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tsta3P23591 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tsta3P23591 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tsta3P23591 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tsta3P23591 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tsta3P23591 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tsta3P23591 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tsta3P23591 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tsta3P23591 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tsta3P23591 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tsta3P23591 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tsta3P23591 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tsta3P23591 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tsta3P23591 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tsta3P23591 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tsta3P23591 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tsta3P23591 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tsta3P23591 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tsta3P23591 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tsta3P23591 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tsta3P23591 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tsta3P23591 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tsta3P23591 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tsta3P23591 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tsta3P23591 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tsta3P23591 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tsta3P23591 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tsta3P23591 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tsta3P23591 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tsta3P23591 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tsta3P23591 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tsta3P23591 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tsta3P23591 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tsta3P23591 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tsta3P23591 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tsta3P23591 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms