Protein–RNA interactions for Protein: P21658

Fgf6, Fibroblast growth factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf6P21658 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fgf6P21658 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fgf6P21658 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fgf6P21658 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fgf6P21658 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fgf6P21658 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fgf6P21658 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Fgf6P21658 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fgf6P21658 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fgf6P21658 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fgf6P21658 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fgf6P21658 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fgf6P21658 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fgf6P21658 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fgf6P21658 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fgf6P21658 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fgf6P21658 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fgf6P21658 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fgf6P21658 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fgf6P21658 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fgf6P21658 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fgf6P21658 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fgf6P21658 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fgf6P21658 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fgf6P21658 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fgf6P21658 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fgf6P21658 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fgf6P21658 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fgf6P21658 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fgf6P21658 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fgf6P21658 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fgf6P21658 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fgf6P21658 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fgf6P21658 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fgf6P21658 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fgf6P21658 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fgf6P21658 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fgf6P21658 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fgf6P21658 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Fgf6P21658 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fgf6P21658 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fgf6P21658 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fgf6P21658 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fgf6P21658 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fgf6P21658 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fgf6P21658 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fgf6P21658 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fgf6P21658 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fgf6P21658 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fgf6P21658 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fgf6P21658 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fgf6P21658 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fgf6P21658 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fgf6P21658 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fgf6P21658 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fgf6P21658 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fgf6P21658 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Fgf6P21658 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fgf6P21658 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fgf6P21658 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fgf6P21658 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fgf6P21658 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fgf6P21658 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fgf6P21658 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fgf6P21658 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Fgf6P21658 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fgf6P21658 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fgf6P21658 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fgf6P21658 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fgf6P21658 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fgf6P21658 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fgf6P21658 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fgf6P21658 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fgf6P21658 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Fgf6P21658 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fgf6P21658 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fgf6P21658 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fgf6P21658 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fgf6P21658 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fgf6P21658 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fgf6P21658 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fgf6P21658 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fgf6P21658 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Fgf6P21658 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fgf6P21658 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fgf6P21658 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Fgf6P21658 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fgf6P21658 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fgf6P21658 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fgf6P21658 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fgf6P21658 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fgf6P21658 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fgf6P21658 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fgf6P21658 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fgf6P21658 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fgf6P21658 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fgf6P21658 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fgf6P21658 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fgf6P21658 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fgf6P21658 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms