Protein–RNA interactions for Protein: P18340

Cxcl9, C-X-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl9P18340 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cxcl9P18340 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cxcl9P18340 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cxcl9P18340 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cxcl9P18340 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cxcl9P18340 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cxcl9P18340 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cxcl9P18340 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cxcl9P18340 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cxcl9P18340 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cxcl9P18340 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cxcl9P18340 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cxcl9P18340 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cxcl9P18340 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cxcl9P18340 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cxcl9P18340 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Cxcl9P18340 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Cxcl9P18340 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cxcl9P18340 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cxcl9P18340 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cxcl9P18340 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cxcl9P18340 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cxcl9P18340 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cxcl9P18340 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cxcl9P18340 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cxcl9P18340 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Cxcl9P18340 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cxcl9P18340 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cxcl9P18340 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cxcl9P18340 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cxcl9P18340 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cxcl9P18340 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cxcl9P18340 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Cxcl9P18340 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cxcl9P18340 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cxcl9P18340 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cxcl9P18340 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cxcl9P18340 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cxcl9P18340 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cxcl9P18340 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cxcl9P18340 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cxcl9P18340 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cxcl9P18340 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Cxcl9P18340 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cxcl9P18340 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cxcl9P18340 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cxcl9P18340 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cxcl9P18340 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cxcl9P18340 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cxcl9P18340 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cxcl9P18340 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cxcl9P18340 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Cxcl9P18340 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cxcl9P18340 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cxcl9P18340 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cxcl9P18340 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cxcl9P18340 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cxcl9P18340 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cxcl9P18340 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cxcl9P18340 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cxcl9P18340 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cxcl9P18340 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cxcl9P18340 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cxcl9P18340 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cxcl9P18340 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Cxcl9P18340 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cxcl9P18340 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cxcl9P18340 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cxcl9P18340 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cxcl9P18340 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cxcl9P18340 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cxcl9P18340 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cxcl9P18340 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cxcl9P18340 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cxcl9P18340 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cxcl9P18340 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cxcl9P18340 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cxcl9P18340 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cxcl9P18340 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cxcl9P18340 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cxcl9P18340 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cxcl9P18340 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cxcl9P18340 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cxcl9P18340 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cxcl9P18340 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cxcl9P18340 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cxcl9P18340 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cxcl9P18340 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cxcl9P18340 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cxcl9P18340 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cxcl9P18340 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cxcl9P18340 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cxcl9P18340 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cxcl9P18340 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cxcl9P18340 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cxcl9P18340 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Cxcl9P18340 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cxcl9P18340 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cxcl9P18340 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cxcl9P18340 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.1 ms