Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxb1P17919 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxb1P17919 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxb1P17919 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxb1P17919 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxb1P17919 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxb1P17919 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxb1P17919 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxb1P17919 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxb1P17919 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxb1P17919 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxb1P17919 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxb1P17919 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxb1P17919 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxb1P17919 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxb1P17919 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxb1P17919 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxb1P17919 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxb1P17919 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxb1P17919 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxb1P17919 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxb1P17919 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxb1P17919 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxb1P17919 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxb1P17919 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxb1P17919 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxb1P17919 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxb1P17919 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxb1P17919 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxb1P17919 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxb1P17919 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxb1P17919 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxb1P17919 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxb1P17919 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxb1P17919 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxb1P17919 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxb1P17919 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxb1P17919 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxb1P17919 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxb1P17919 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxb1P17919 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxb1P17919 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxb1P17919 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxb1P17919 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxb1P17919 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxb1P17919 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxb1P17919 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxb1P17919 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxb1P17919 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxb1P17919 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxb1P17919 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxb1P17919 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxb1P17919 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxb1P17919 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxb1P17919 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxb1P17919 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxb1P17919 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxb1P17919 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxb1P17919 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Hoxb1P17919 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxb1P17919 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxb1P17919 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxb1P17919 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxb1P17919 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxb1P17919 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxb1P17919 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxb1P17919 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxb1P17919 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxb1P17919 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxb1P17919 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxb1P17919 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxb1P17919 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxb1P17919 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxb1P17919 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxb1P17919 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxb1P17919 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxb1P17919 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxb1P17919 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxb1P17919 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxb1P17919 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxb1P17919 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxb1P17919 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxb1P17919 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxb1P17919 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxb1P17919 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxb1P17919 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxb1P17919 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxb1P17919 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxb1P17919 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxb1P17919 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxb1P17919 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxb1P17919 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxb1P17919 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxb1P17919 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxb1P17919 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxb1P17919 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxb1P17919 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxb1P17919 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxb1P17919 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxb1P17919 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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