Protein–RNA interactions for Protein: P11403

Fgf4, Fibroblast growth factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf4P11403 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fgf4P11403 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fgf4P11403 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fgf4P11403 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fgf4P11403 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fgf4P11403 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fgf4P11403 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fgf4P11403 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fgf4P11403 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fgf4P11403 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fgf4P11403 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fgf4P11403 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fgf4P11403 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fgf4P11403 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fgf4P11403 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fgf4P11403 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fgf4P11403 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fgf4P11403 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fgf4P11403 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fgf4P11403 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fgf4P11403 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fgf4P11403 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fgf4P11403 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fgf4P11403 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fgf4P11403 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fgf4P11403 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fgf4P11403 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fgf4P11403 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fgf4P11403 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fgf4P11403 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fgf4P11403 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Fgf4P11403 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fgf4P11403 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fgf4P11403 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fgf4P11403 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fgf4P11403 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fgf4P11403 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fgf4P11403 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fgf4P11403 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fgf4P11403 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fgf4P11403 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fgf4P11403 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fgf4P11403 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fgf4P11403 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fgf4P11403 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fgf4P11403 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fgf4P11403 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fgf4P11403 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fgf4P11403 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fgf4P11403 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fgf4P11403 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fgf4P11403 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Fgf4P11403 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fgf4P11403 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Fgf4P11403 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fgf4P11403 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fgf4P11403 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fgf4P11403 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fgf4P11403 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fgf4P11403 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fgf4P11403 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fgf4P11403 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fgf4P11403 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fgf4P11403 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fgf4P11403 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fgf4P11403 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fgf4P11403 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fgf4P11403 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fgf4P11403 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fgf4P11403 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fgf4P11403 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fgf4P11403 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fgf4P11403 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fgf4P11403 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fgf4P11403 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fgf4P11403 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fgf4P11403 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fgf4P11403 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fgf4P11403 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fgf4P11403 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fgf4P11403 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fgf4P11403 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fgf4P11403 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fgf4P11403 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgf4P11403 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgf4P11403 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgf4P11403 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgf4P11403 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgf4P11403 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Fgf4P11403 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgf4P11403 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgf4P11403 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgf4P11403 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgf4P11403 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgf4P11403 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgf4P11403 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgf4P11403 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgf4P11403 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgf4P11403 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgf4P11403 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 551 ms