Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccl2P10148 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccl2P10148 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccl2P10148 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccl2P10148 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl2P10148 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl2P10148 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl2P10148 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl2P10148 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl2P10148 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl2P10148 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl2P10148 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccl2P10148 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccl2P10148 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccl2P10148 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccl2P10148 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccl2P10148 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccl2P10148 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccl2P10148 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccl2P10148 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl2P10148 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl2P10148 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl2P10148 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl2P10148 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl2P10148 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl2P10148 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl2P10148 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl2P10148 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl2P10148 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl2P10148 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl2P10148 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl2P10148 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl2P10148 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl2P10148 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl2P10148 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl2P10148 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccl2P10148 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccl2P10148 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl2P10148 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl2P10148 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl2P10148 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl2P10148 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl2P10148 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl2P10148 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl2P10148 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl2P10148 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl2P10148 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl2P10148 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl2P10148 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl2P10148 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl2P10148 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl2P10148 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl2P10148 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl2P10148 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl2P10148 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl2P10148 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl2P10148 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl2P10148 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl2P10148 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl2P10148 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl2P10148 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl2P10148 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl2P10148 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl2P10148 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl2P10148 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl2P10148 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl2P10148 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl2P10148 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl2P10148 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl2P10148 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl2P10148 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl2P10148 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl2P10148 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl2P10148 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl2P10148 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl2P10148 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccl2P10148 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccl2P10148 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccl2P10148 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccl2P10148 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccl2P10148 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl2P10148 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl2P10148 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl2P10148 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl2P10148 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl2P10148 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl2P10148 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl2P10148 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl2P10148 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl2P10148 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccl2P10148 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl2P10148 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl2P10148 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl2P10148 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl2P10148 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl2P10148 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl2P10148 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl2P10148 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl2P10148 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl2P10148 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms