Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Schip1P0DPB4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Schip1P0DPB4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Schip1P0DPB4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Schip1P0DPB4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Schip1P0DPB4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Schip1P0DPB4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Schip1P0DPB4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Schip1P0DPB4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Schip1P0DPB4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Schip1P0DPB4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Schip1P0DPB4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Schip1P0DPB4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Schip1P0DPB4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Schip1P0DPB4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Schip1P0DPB4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Schip1P0DPB4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Schip1P0DPB4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Schip1P0DPB4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Schip1P0DPB4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Schip1P0DPB4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Schip1P0DPB4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Schip1P0DPB4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Schip1P0DPB4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Schip1P0DPB4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Schip1P0DPB4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Schip1P0DPB4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Schip1P0DPB4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Schip1P0DPB4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Schip1P0DPB4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Schip1P0DPB4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Schip1P0DPB4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Schip1P0DPB4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Schip1P0DPB4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Schip1P0DPB4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Schip1P0DPB4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Schip1P0DPB4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Schip1P0DPB4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Schip1P0DPB4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Schip1P0DPB4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Schip1P0DPB4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Schip1P0DPB4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Schip1P0DPB4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Schip1P0DPB4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Schip1P0DPB4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Schip1P0DPB4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Schip1P0DPB4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Schip1P0DPB4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Schip1P0DPB4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Schip1P0DPB4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Schip1P0DPB4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Schip1P0DPB4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Schip1P0DPB4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Schip1P0DPB4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Schip1P0DPB4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Schip1P0DPB4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Schip1P0DPB4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Schip1P0DPB4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Schip1P0DPB4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Schip1P0DPB4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Schip1P0DPB4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Schip1P0DPB4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Schip1P0DPB4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Schip1P0DPB4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Schip1P0DPB4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Schip1P0DPB4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Schip1P0DPB4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Schip1P0DPB4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Schip1P0DPB4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Schip1P0DPB4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Schip1P0DPB4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Schip1P0DPB4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Schip1P0DPB4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Schip1P0DPB4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Schip1P0DPB4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Schip1P0DPB4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Schip1P0DPB4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Schip1P0DPB4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Schip1P0DPB4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Schip1P0DPB4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Schip1P0DPB4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Schip1P0DPB4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Schip1P0DPB4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Schip1P0DPB4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Schip1P0DPB4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Schip1P0DPB4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Schip1P0DPB4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Schip1P0DPB4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Schip1P0DPB4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Schip1P0DPB4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Schip1P0DPB4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Schip1P0DPB4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Schip1P0DPB4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Schip1P0DPB4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Schip1P0DPB4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Schip1P0DPB4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Schip1P0DPB4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Schip1P0DPB4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Schip1P0DPB4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Schip1P0DPB4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms