Protein–RNA interactions for Protein: P08551

Nefl, Neurofilament light polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeflP08551 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NeflP08551 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NeflP08551 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NeflP08551 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NeflP08551 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NeflP08551 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NeflP08551 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NeflP08551 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NeflP08551 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NeflP08551 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NeflP08551 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NeflP08551 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NeflP08551 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NeflP08551 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NeflP08551 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
NeflP08551 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NeflP08551 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NeflP08551 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NeflP08551 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NeflP08551 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NeflP08551 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NeflP08551 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NeflP08551 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NeflP08551 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NeflP08551 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NeflP08551 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NeflP08551 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NeflP08551 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NeflP08551 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NeflP08551 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NeflP08551 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NeflP08551 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NeflP08551 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NeflP08551 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NeflP08551 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NeflP08551 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NeflP08551 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NeflP08551 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NeflP08551 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NeflP08551 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NeflP08551 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NeflP08551 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NeflP08551 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NeflP08551 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NeflP08551 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NeflP08551 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NeflP08551 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NeflP08551 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NeflP08551 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NeflP08551 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NeflP08551 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NeflP08551 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NeflP08551 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NeflP08551 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NeflP08551 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NeflP08551 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NeflP08551 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NeflP08551 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
NeflP08551 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NeflP08551 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NeflP08551 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NeflP08551 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NeflP08551 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NeflP08551 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NeflP08551 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NeflP08551 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NeflP08551 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NeflP08551 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NeflP08551 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NeflP08551 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NeflP08551 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NeflP08551 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
NeflP08551 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NeflP08551 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NeflP08551 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NeflP08551 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NeflP08551 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NeflP08551 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NeflP08551 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NeflP08551 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NeflP08551 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NeflP08551 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NeflP08551 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NeflP08551 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NeflP08551 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NeflP08551 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NeflP08551 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NeflP08551 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NeflP08551 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NeflP08551 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NeflP08551 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NeflP08551 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NeflP08551 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NeflP08551 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NeflP08551 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NeflP08551 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NeflP08551 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NeflP08551 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NeflP08551 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NeflP08551 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms