Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TtrP07309 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TtrP07309 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TtrP07309 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TtrP07309 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TtrP07309 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TtrP07309 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TtrP07309 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TtrP07309 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TtrP07309 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TtrP07309 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TtrP07309 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TtrP07309 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TtrP07309 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TtrP07309 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TtrP07309 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TtrP07309 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TtrP07309 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TtrP07309 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TtrP07309 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TtrP07309 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TtrP07309 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TtrP07309 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TtrP07309 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TtrP07309 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TtrP07309 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TtrP07309 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TtrP07309 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TtrP07309 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TtrP07309 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TtrP07309 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TtrP07309 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TtrP07309 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TtrP07309 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
TtrP07309 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TtrP07309 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TtrP07309 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TtrP07309 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TtrP07309 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TtrP07309 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TtrP07309 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TtrP07309 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TtrP07309 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TtrP07309 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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TtrP07309 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TtrP07309 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TtrP07309 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TtrP07309 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TtrP07309 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TtrP07309 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TtrP07309 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TtrP07309 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TtrP07309 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TtrP07309 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TtrP07309 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TtrP07309 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TtrP07309 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TtrP07309 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TtrP07309 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TtrP07309 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TtrP07309 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TtrP07309 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TtrP07309 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TtrP07309 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TtrP07309 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TtrP07309 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TtrP07309 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TtrP07309 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TtrP07309 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TtrP07309 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TtrP07309 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TtrP07309 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TtrP07309 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TtrP07309 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TtrP07309 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TtrP07309 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TtrP07309 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TtrP07309 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TtrP07309 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TtrP07309 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TtrP07309 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TtrP07309 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TtrP07309 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TtrP07309 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TtrP07309 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TtrP07309 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TtrP07309 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TtrP07309 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TtrP07309 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TtrP07309 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TtrP07309 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TtrP07309 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TtrP07309 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TtrP07309 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TtrP07309 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TtrP07309 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TtrP07309 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TtrP07309 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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