Protein–RNA interactions for Protein: P06801

Me1, NADP-dependent malic enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me1P06801 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Me1P06801 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Me1P06801 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Me1P06801 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Me1P06801 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Me1P06801 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Me1P06801 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Me1P06801 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Me1P06801 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Me1P06801 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Me1P06801 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Me1P06801 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Me1P06801 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Me1P06801 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Me1P06801 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Me1P06801 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Me1P06801 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Me1P06801 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Me1P06801 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Me1P06801 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Me1P06801 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Me1P06801 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Me1P06801 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Me1P06801 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Me1P06801 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Me1P06801 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Me1P06801 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Me1P06801 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Me1P06801 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Me1P06801 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Me1P06801 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Me1P06801 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Me1P06801 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Me1P06801 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Me1P06801 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Me1P06801 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Me1P06801 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Me1P06801 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Me1P06801 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Me1P06801 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Me1P06801 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Me1P06801 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Me1P06801 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Me1P06801 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Me1P06801 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Me1P06801 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Me1P06801 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Me1P06801 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Me1P06801 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Me1P06801 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Me1P06801 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Me1P06801 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Me1P06801 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Me1P06801 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Me1P06801 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Me1P06801 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Me1P06801 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Me1P06801 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Me1P06801 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Me1P06801 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Me1P06801 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Me1P06801 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Me1P06801 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Me1P06801 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Me1P06801 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Me1P06801 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Me1P06801 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Me1P06801 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Me1P06801 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Me1P06801 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Me1P06801 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Me1P06801 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Me1P06801 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Me1P06801 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Me1P06801 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Me1P06801 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Me1P06801 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Me1P06801 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Me1P06801 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Me1P06801 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Me1P06801 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Me1P06801 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Me1P06801 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Me1P06801 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Me1P06801 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Me1P06801 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Me1P06801 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Me1P06801 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Me1P06801 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Me1P06801 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Me1P06801 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Me1P06801 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Me1P06801 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Me1P06801 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Me1P06801 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Me1P06801 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Me1P06801 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Me1P06801 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Me1P06801 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Me1P06801 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms