Protein–RNA interactions for Protein: P01910

H2-Aa, H-2 class II histocompatibility antigen, A-K alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-AaP01910 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
H2-AaP01910 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
H2-AaP01910 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
H2-AaP01910 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
H2-AaP01910 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
H2-AaP01910 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
H2-AaP01910 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
H2-AaP01910 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
H2-AaP01910 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
H2-AaP01910 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
H2-AaP01910 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
H2-AaP01910 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
H2-AaP01910 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
H2-AaP01910 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
H2-AaP01910 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
H2-AaP01910 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
H2-AaP01910 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
H2-AaP01910 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
H2-AaP01910 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
H2-AaP01910 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
H2-AaP01910 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
H2-AaP01910 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
H2-AaP01910 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
H2-AaP01910 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
H2-AaP01910 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
H2-AaP01910 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
H2-AaP01910 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
H2-AaP01910 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
H2-AaP01910 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
H2-AaP01910 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
H2-AaP01910 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
H2-AaP01910 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
H2-AaP01910 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
H2-AaP01910 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
H2-AaP01910 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
H2-AaP01910 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
H2-AaP01910 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
H2-AaP01910 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
H2-AaP01910 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
H2-AaP01910 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
H2-AaP01910 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
H2-AaP01910 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
H2-AaP01910 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
H2-AaP01910 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
H2-AaP01910 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
H2-AaP01910 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
H2-AaP01910 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
H2-AaP01910 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
H2-AaP01910 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
H2-AaP01910 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
H2-AaP01910 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
H2-AaP01910 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
H2-AaP01910 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
H2-AaP01910 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
H2-AaP01910 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
H2-AaP01910 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
H2-AaP01910 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
H2-AaP01910 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
H2-AaP01910 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
H2-AaP01910 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
H2-AaP01910 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
H2-AaP01910 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
H2-AaP01910 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
H2-AaP01910 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
H2-AaP01910 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
H2-AaP01910 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
H2-AaP01910 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
H2-AaP01910 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
H2-AaP01910 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
H2-AaP01910 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
H2-AaP01910 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
H2-AaP01910 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
H2-AaP01910 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
H2-AaP01910 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
H2-AaP01910 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
H2-AaP01910 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
H2-AaP01910 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
H2-AaP01910 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
H2-AaP01910 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
H2-AaP01910 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
H2-AaP01910 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
H2-AaP01910 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
H2-AaP01910 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
H2-AaP01910 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
H2-AaP01910 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
H2-AaP01910 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
H2-AaP01910 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
H2-AaP01910 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
H2-AaP01910 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
H2-AaP01910 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
H2-AaP01910 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
H2-AaP01910 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
H2-AaP01910 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
H2-AaP01910 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
H2-AaP01910 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
H2-AaP01910 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
H2-AaP01910 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
H2-AaP01910 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
H2-AaP01910 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
H2-AaP01910 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms