Protein–RNA interactions for Protein: P01823

Ig heavy chain V region 36-60, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01823 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01823 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
P01823 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01823 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01823 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01823 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01823 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01823 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01823 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P01823 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01823 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01823 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01823 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01823 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01823 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01823 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01823 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01823 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01823 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01823 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01823 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
P01823 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01823 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01823 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01823 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01823 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01823 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01823 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01823 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01823 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01823 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01823 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
P01823 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01823 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01823 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01823 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01823 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01823 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01823 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
P01823 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01823 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01823 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01823 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01823 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01823 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01823 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01823 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01823 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01823 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01823 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01823 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01823 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01823 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
P01823 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01823 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01823 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01823 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01823 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01823 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
P01823 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01823 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01823 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01823 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01823 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01823 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01823 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01823 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01823 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01823 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01823 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01823 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01823 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01823 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01823 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01823 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01823 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01823 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01823 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01823 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01823 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01823 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01823 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01823 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01823 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01823 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01823 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01823 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01823 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01823 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01823 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01823 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01823 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01823 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01823 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01823 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01823 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01823 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01823 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01823 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01823 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms