Protein–RNA interactions for Protein: P01793

Ig heavy chain V region HPCG13, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01793 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01793 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01793 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01793 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01793 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01793 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01793 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01793 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01793 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01793 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01793 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01793 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01793 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01793 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01793 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01793 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01793 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01793 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01793 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01793 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01793 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01793 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01793 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01793 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01793 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01793 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01793 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01793 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01793 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01793 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01793 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01793 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01793 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01793 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01793 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01793 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01793 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01793 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01793 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01793 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01793 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01793 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01793 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01793 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01793 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01793 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01793 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01793 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01793 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01793 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01793 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01793 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01793 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01793 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01793 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01793 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01793 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
P01793 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01793 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01793 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01793 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01793 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01793 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01793 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01793 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01793 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01793 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01793 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01793 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01793 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01793 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01793 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01793 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01793 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01793 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01793 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01793 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01793 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01793 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01793 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01793 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01793 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01793 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01793 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
P01793 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01793 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01793 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01793 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01793 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01793 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01793 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01793 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01793 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
P01793 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01793 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01793 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01793 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01793 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01793 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01793 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms