Protein–RNA interactions for Protein: P01793

Ig heavy chain V region HPCG13, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01793 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01793 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01793 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01793 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01793 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01793 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01793 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01793 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01793 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01793 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01793 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01793 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01793 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01793 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01793 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01793 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01793 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01793 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01793 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01793 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01793 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01793 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01793 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01793 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01793 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01793 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01793 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01793 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01793 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01793 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01793 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01793 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01793 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01793 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01793 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01793 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01793 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01793 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01793 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01793 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01793 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01793 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01793 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01793 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01793 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01793 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01793 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01793 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01793 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01793 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01793 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01793 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01793 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01793 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01793 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01793 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01793 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
P01793 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01793 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01793 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01793 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01793 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01793 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01793 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01793 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01793 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01793 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01793 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01793 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01793 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01793 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01793 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01793 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01793 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01793 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01793 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01793 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01793 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01793 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01793 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01793 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01793 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01793 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01793 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
P01793 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01793 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01793 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01793 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01793 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01793 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01793 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01793 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01793 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
P01793 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01793 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01793 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01793 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01793 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01793 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01793 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms