Protein–RNA interactions for Protein: P01734

T-cell receptor beta chain V region 3H.25, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01734 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
P01734 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
P01734 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
P01734 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
P01734 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
P01734 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
P01734 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
P01734 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
P01734 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
P01734 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
P01734 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
P01734 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
P01734 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
P01734 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
P01734 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
P01734 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
P01734 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
P01734 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
P01734 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
P01734 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
P01734 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
P01734 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
P01734 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
P01734 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
P01734 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
P01734 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
P01734 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
P01734 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
P01734 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
P01734 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
P01734 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
P01734 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
P01734 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
P01734 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
P01734 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
P01734 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
P01734 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
P01734 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
P01734 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
P01734 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
P01734 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
P01734 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
P01734 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
P01734 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
P01734 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
P01734 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
P01734 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
P01734 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
P01734 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
P01734 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
P01734 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
P01734 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
P01734 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
P01734 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
P01734 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
P01734 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
P01734 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
P01734 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
P01734 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
P01734 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
P01734 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
P01734 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
P01734 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
P01734 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
P01734 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
P01734 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
P01734 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
P01734 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
P01734 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
P01734 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
P01734 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
P01734 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
P01734 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
P01734 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
P01734 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
P01734 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
P01734 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
P01734 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
P01734 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
P01734 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
P01734 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
P01734 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
P01734 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
P01734 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
P01734 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
P01734 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
P01734 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
P01734 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
P01734 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
P01734 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
P01734 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
P01734 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
P01734 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
P01734 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
P01734 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
P01734 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
P01734 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
P01734 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
P01734 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
P01734 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms