Protein–RNA interactions for Protein: P01029

C4b, Complement C4-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4bP01029 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
C4bP01029 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
C4bP01029 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
C4bP01029 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
C4bP01029 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
C4bP01029 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
C4bP01029 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
C4bP01029 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
C4bP01029 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
C4bP01029 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
C4bP01029 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
C4bP01029 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
C4bP01029 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
C4bP01029 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
C4bP01029 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
C4bP01029 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
C4bP01029 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
C4bP01029 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
C4bP01029 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
C4bP01029 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
C4bP01029 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
C4bP01029 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
C4bP01029 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
C4bP01029 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
C4bP01029 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
C4bP01029 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
C4bP01029 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
C4bP01029 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
C4bP01029 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
C4bP01029 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
C4bP01029 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
C4bP01029 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
C4bP01029 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
C4bP01029 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
C4bP01029 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
C4bP01029 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
C4bP01029 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
C4bP01029 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
C4bP01029 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
C4bP01029 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
C4bP01029 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
C4bP01029 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
C4bP01029 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
C4bP01029 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
C4bP01029 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
C4bP01029 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
C4bP01029 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
C4bP01029 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
C4bP01029 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
C4bP01029 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
C4bP01029 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
C4bP01029 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
C4bP01029 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
C4bP01029 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
C4bP01029 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
C4bP01029 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
C4bP01029 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
C4bP01029 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
C4bP01029 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
C4bP01029 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
C4bP01029 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
C4bP01029 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
C4bP01029 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
C4bP01029 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
C4bP01029 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
C4bP01029 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
C4bP01029 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
C4bP01029 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
C4bP01029 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
C4bP01029 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
C4bP01029 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
C4bP01029 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
C4bP01029 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
C4bP01029 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
C4bP01029 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
C4bP01029 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
C4bP01029 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
C4bP01029 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
C4bP01029 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
C4bP01029 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
C4bP01029 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
C4bP01029 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
C4bP01029 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
C4bP01029 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
C4bP01029 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
C4bP01029 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
C4bP01029 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
C4bP01029 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
C4bP01029 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
C4bP01029 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
C4bP01029 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
C4bP01029 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
C4bP01029 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
C4bP01029 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
C4bP01029 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
C4bP01029 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
C4bP01029 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
C4bP01029 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
C4bP01029 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
C4bP01029 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms