Protein–RNA interactions for Protein: O88968

Tcn2, Transcobalamin-2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcn2O88968 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tcn2O88968 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tcn2O88968 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tcn2O88968 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tcn2O88968 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tcn2O88968 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tcn2O88968 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tcn2O88968 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tcn2O88968 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tcn2O88968 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tcn2O88968 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tcn2O88968 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tcn2O88968 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tcn2O88968 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tcn2O88968 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tcn2O88968 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tcn2O88968 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tcn2O88968 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tcn2O88968 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tcn2O88968 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tcn2O88968 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tcn2O88968 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tcn2O88968 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tcn2O88968 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tcn2O88968 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tcn2O88968 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Tcn2O88968 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tcn2O88968 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tcn2O88968 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tcn2O88968 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tcn2O88968 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tcn2O88968 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tcn2O88968 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tcn2O88968 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tcn2O88968 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tcn2O88968 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tcn2O88968 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tcn2O88968 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tcn2O88968 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tcn2O88968 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tcn2O88968 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tcn2O88968 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tcn2O88968 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tcn2O88968 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tcn2O88968 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tcn2O88968 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tcn2O88968 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tcn2O88968 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tcn2O88968 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tcn2O88968 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Tcn2O88968 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tcn2O88968 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tcn2O88968 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Tcn2O88968 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tcn2O88968 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tcn2O88968 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tcn2O88968 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tcn2O88968 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tcn2O88968 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tcn2O88968 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tcn2O88968 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tcn2O88968 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tcn2O88968 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tcn2O88968 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tcn2O88968 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tcn2O88968 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tcn2O88968 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tcn2O88968 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tcn2O88968 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tcn2O88968 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tcn2O88968 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Tcn2O88968 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Tcn2O88968 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tcn2O88968 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tcn2O88968 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tcn2O88968 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tcn2O88968 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tcn2O88968 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Tcn2O88968 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tcn2O88968 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tcn2O88968 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tcn2O88968 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Tcn2O88968 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Tcn2O88968 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tcn2O88968 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tcn2O88968 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tcn2O88968 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tcn2O88968 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tcn2O88968 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tcn2O88968 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tcn2O88968 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tcn2O88968 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tcn2O88968 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tcn2O88968 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tcn2O88968 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tcn2O88968 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tcn2O88968 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tcn2O88968 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tcn2O88968 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tcn2O88968 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms