Protein–RNA interactions for Protein: O88870

Best1, Bestrophin-1, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best1O88870 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Best1O88870 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Best1O88870 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Best1O88870 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Best1O88870 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Best1O88870 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Best1O88870 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Best1O88870 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Best1O88870 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Best1O88870 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Best1O88870 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Best1O88870 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Best1O88870 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Best1O88870 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Best1O88870 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Best1O88870 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Best1O88870 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Best1O88870 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Best1O88870 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Best1O88870 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Best1O88870 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Best1O88870 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Best1O88870 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Best1O88870 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Best1O88870 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Best1O88870 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Best1O88870 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Best1O88870 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Best1O88870 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Best1O88870 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Best1O88870 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Best1O88870 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Best1O88870 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Best1O88870 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Best1O88870 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Best1O88870 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Best1O88870 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Best1O88870 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Best1O88870 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Best1O88870 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Best1O88870 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Best1O88870 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Best1O88870 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Best1O88870 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Best1O88870 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Best1O88870 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Best1O88870 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Best1O88870 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Best1O88870 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Best1O88870 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Best1O88870 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Best1O88870 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Best1O88870 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Best1O88870 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Best1O88870 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Best1O88870 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Best1O88870 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Best1O88870 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Best1O88870 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Best1O88870 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Best1O88870 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Best1O88870 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Best1O88870 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Best1O88870 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Best1O88870 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Best1O88870 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Best1O88870 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Best1O88870 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Best1O88870 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Best1O88870 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Best1O88870 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Best1O88870 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Best1O88870 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Best1O88870 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Best1O88870 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Best1O88870 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Best1O88870 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Best1O88870 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Best1O88870 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Best1O88870 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Best1O88870 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Best1O88870 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Best1O88870 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Best1O88870 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Best1O88870 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Best1O88870 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Best1O88870 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Best1O88870 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Best1O88870 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Best1O88870 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Best1O88870 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Best1O88870 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Best1O88870 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Best1O88870 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Best1O88870 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Best1O88870 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Best1O88870 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Best1O88870 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Best1O88870 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Best1O88870 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms