Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
BlmO88700 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
BlmO88700 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
BlmO88700 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
BlmO88700 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
BlmO88700 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
BlmO88700 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
BlmO88700 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
BlmO88700 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
BlmO88700 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
BlmO88700 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
BlmO88700 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
BlmO88700 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
BlmO88700 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
BlmO88700 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
BlmO88700 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
BlmO88700 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
BlmO88700 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
BlmO88700 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
BlmO88700 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
BlmO88700 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
BlmO88700 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
BlmO88700 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
BlmO88700 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
BlmO88700 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
BlmO88700 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
BlmO88700 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
BlmO88700 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
BlmO88700 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
BlmO88700 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
BlmO88700 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
BlmO88700 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
BlmO88700 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
BlmO88700 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
BlmO88700 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
BlmO88700 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
BlmO88700 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC34.83■■■■□ 3.17
BlmO88700 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
BlmO88700 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
BlmO88700 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC34.82■■■■□ 3.17
BlmO88700 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
BlmO88700 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
BlmO88700 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
BlmO88700 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
BlmO88700 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
BlmO88700 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
BlmO88700 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
BlmO88700 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
BlmO88700 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC34.8■■■■□ 3.16
BlmO88700 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
BlmO88700 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
BlmO88700 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
BlmO88700 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
BlmO88700 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC34.78■■■■□ 3.16
BlmO88700 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
BlmO88700 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
BlmO88700 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
BlmO88700 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
BlmO88700 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
BlmO88700 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
BlmO88700 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
BlmO88700 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
BlmO88700 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
BlmO88700 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
BlmO88700 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
BlmO88700 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
BlmO88700 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
BlmO88700 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
BlmO88700 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
BlmO88700 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
BlmO88700 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
BlmO88700 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
BlmO88700 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
BlmO88700 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
BlmO88700 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
BlmO88700 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
BlmO88700 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
BlmO88700 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
BlmO88700 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
BlmO88700 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
BlmO88700 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
BlmO88700 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
BlmO88700 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
BlmO88700 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
BlmO88700 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
BlmO88700 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
BlmO88700 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
BlmO88700 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
BlmO88700 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC34.7■■■■□ 3.15
BlmO88700 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
BlmO88700 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
BlmO88700 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
BlmO88700 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
BlmO88700 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
BlmO88700 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
BlmO88700 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
BlmO88700 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
BlmO88700 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
BlmO88700 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
BlmO88700 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms