Protein–RNA interactions for Protein: O88552

Cldn2, Claudin-2, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn2O88552 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cldn2O88552 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cldn2O88552 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Cldn2O88552 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cldn2O88552 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cldn2O88552 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cldn2O88552 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cldn2O88552 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cldn2O88552 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cldn2O88552 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cldn2O88552 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cldn2O88552 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cldn2O88552 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cldn2O88552 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cldn2O88552 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cldn2O88552 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cldn2O88552 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cldn2O88552 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cldn2O88552 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cldn2O88552 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cldn2O88552 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cldn2O88552 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cldn2O88552 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cldn2O88552 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cldn2O88552 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cldn2O88552 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cldn2O88552 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cldn2O88552 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cldn2O88552 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cldn2O88552 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cldn2O88552 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cldn2O88552 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cldn2O88552 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cldn2O88552 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cldn2O88552 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cldn2O88552 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cldn2O88552 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cldn2O88552 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cldn2O88552 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cldn2O88552 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cldn2O88552 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cldn2O88552 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cldn2O88552 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cldn2O88552 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cldn2O88552 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cldn2O88552 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cldn2O88552 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cldn2O88552 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cldn2O88552 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cldn2O88552 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cldn2O88552 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cldn2O88552 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cldn2O88552 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cldn2O88552 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cldn2O88552 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cldn2O88552 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cldn2O88552 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cldn2O88552 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cldn2O88552 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cldn2O88552 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cldn2O88552 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cldn2O88552 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cldn2O88552 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cldn2O88552 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cldn2O88552 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cldn2O88552 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cldn2O88552 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cldn2O88552 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cldn2O88552 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cldn2O88552 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cldn2O88552 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cldn2O88552 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cldn2O88552 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cldn2O88552 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cldn2O88552 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cldn2O88552 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cldn2O88552 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cldn2O88552 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cldn2O88552 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cldn2O88552 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cldn2O88552 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cldn2O88552 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cldn2O88552 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cldn2O88552 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cldn2O88552 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cldn2O88552 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cldn2O88552 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cldn2O88552 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cldn2O88552 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cldn2O88552 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cldn2O88552 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cldn2O88552 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cldn2O88552 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cldn2O88552 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cldn2O88552 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cldn2O88552 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cldn2O88552 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cldn2O88552 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cldn2O88552 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cldn2O88552 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms