Protein–RNA interactions for Protein: O88307

Sorl1, Sortilin-related receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorl1O88307 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sorl1O88307 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sorl1O88307 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sorl1O88307 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sorl1O88307 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sorl1O88307 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sorl1O88307 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Sorl1O88307 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Sorl1O88307 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sorl1O88307 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sorl1O88307 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sorl1O88307 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sorl1O88307 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sorl1O88307 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sorl1O88307 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sorl1O88307 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sorl1O88307 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sorl1O88307 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sorl1O88307 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sorl1O88307 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sorl1O88307 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sorl1O88307 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sorl1O88307 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sorl1O88307 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sorl1O88307 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sorl1O88307 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sorl1O88307 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sorl1O88307 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sorl1O88307 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sorl1O88307 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sorl1O88307 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sorl1O88307 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sorl1O88307 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sorl1O88307 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sorl1O88307 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sorl1O88307 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sorl1O88307 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sorl1O88307 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sorl1O88307 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sorl1O88307 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sorl1O88307 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sorl1O88307 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sorl1O88307 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sorl1O88307 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sorl1O88307 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sorl1O88307 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sorl1O88307 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sorl1O88307 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sorl1O88307 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sorl1O88307 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sorl1O88307 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sorl1O88307 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sorl1O88307 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sorl1O88307 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sorl1O88307 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sorl1O88307 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sorl1O88307 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sorl1O88307 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sorl1O88307 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sorl1O88307 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sorl1O88307 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sorl1O88307 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sorl1O88307 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sorl1O88307 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sorl1O88307 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sorl1O88307 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sorl1O88307 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sorl1O88307 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sorl1O88307 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sorl1O88307 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sorl1O88307 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sorl1O88307 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sorl1O88307 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sorl1O88307 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sorl1O88307 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sorl1O88307 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sorl1O88307 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sorl1O88307 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sorl1O88307 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sorl1O88307 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sorl1O88307 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sorl1O88307 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sorl1O88307 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sorl1O88307 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sorl1O88307 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sorl1O88307 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sorl1O88307 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sorl1O88307 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sorl1O88307 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sorl1O88307 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sorl1O88307 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sorl1O88307 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sorl1O88307 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sorl1O88307 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sorl1O88307 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sorl1O88307 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sorl1O88307 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sorl1O88307 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sorl1O88307 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sorl1O88307 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms