Protein–RNA interactions for Protein: O70491

Stra6, Receptor for retinol uptake STRA6, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra6O70491 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Stra6O70491 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Stra6O70491 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Stra6O70491 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Stra6O70491 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Stra6O70491 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Stra6O70491 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Stra6O70491 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Stra6O70491 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Stra6O70491 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Stra6O70491 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Stra6O70491 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Stra6O70491 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Stra6O70491 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Stra6O70491 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Stra6O70491 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Stra6O70491 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Stra6O70491 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Stra6O70491 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Stra6O70491 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Stra6O70491 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Stra6O70491 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Stra6O70491 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Stra6O70491 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Stra6O70491 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Stra6O70491 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Stra6O70491 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Stra6O70491 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Stra6O70491 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Stra6O70491 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Stra6O70491 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Stra6O70491 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Stra6O70491 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Stra6O70491 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Stra6O70491 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Stra6O70491 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Stra6O70491 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Stra6O70491 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Stra6O70491 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Stra6O70491 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Stra6O70491 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Stra6O70491 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Stra6O70491 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Stra6O70491 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Stra6O70491 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Stra6O70491 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Stra6O70491 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Stra6O70491 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Stra6O70491 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Stra6O70491 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Stra6O70491 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Stra6O70491 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Stra6O70491 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Stra6O70491 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Stra6O70491 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Stra6O70491 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Stra6O70491 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Stra6O70491 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Stra6O70491 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Stra6O70491 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Stra6O70491 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Stra6O70491 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Stra6O70491 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Stra6O70491 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Stra6O70491 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Stra6O70491 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Stra6O70491 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Stra6O70491 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Stra6O70491 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Stra6O70491 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Stra6O70491 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Stra6O70491 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Stra6O70491 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Stra6O70491 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Stra6O70491 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Stra6O70491 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Stra6O70491 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Stra6O70491 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stra6O70491 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stra6O70491 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stra6O70491 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stra6O70491 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stra6O70491 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stra6O70491 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stra6O70491 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stra6O70491 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stra6O70491 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stra6O70491 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stra6O70491 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stra6O70491 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stra6O70491 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stra6O70491 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stra6O70491 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stra6O70491 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Stra6O70491 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stra6O70491 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Stra6O70491 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Stra6O70491 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Stra6O70491 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Stra6O70491 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms