Protein–RNA interactions for Protein: O55176

Pja1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja1O55176 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pja1O55176 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pja1O55176 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pja1O55176 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Pja1O55176 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pja1O55176 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pja1O55176 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pja1O55176 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pja1O55176 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pja1O55176 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pja1O55176 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pja1O55176 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pja1O55176 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pja1O55176 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pja1O55176 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pja1O55176 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pja1O55176 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pja1O55176 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pja1O55176 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pja1O55176 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pja1O55176 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Pja1O55176 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pja1O55176 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pja1O55176 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pja1O55176 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pja1O55176 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pja1O55176 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pja1O55176 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Pja1O55176 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Pja1O55176 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pja1O55176 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pja1O55176 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pja1O55176 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pja1O55176 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pja1O55176 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pja1O55176 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pja1O55176 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pja1O55176 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pja1O55176 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pja1O55176 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pja1O55176 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Pja1O55176 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pja1O55176 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pja1O55176 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pja1O55176 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pja1O55176 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pja1O55176 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pja1O55176 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pja1O55176 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pja1O55176 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pja1O55176 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pja1O55176 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pja1O55176 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pja1O55176 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pja1O55176 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pja1O55176 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pja1O55176 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pja1O55176 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pja1O55176 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Pja1O55176 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pja1O55176 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pja1O55176 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pja1O55176 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pja1O55176 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pja1O55176 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pja1O55176 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pja1O55176 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pja1O55176 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pja1O55176 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pja1O55176 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pja1O55176 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pja1O55176 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pja1O55176 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pja1O55176 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pja1O55176 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pja1O55176 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pja1O55176 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Pja1O55176 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pja1O55176 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pja1O55176 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pja1O55176 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pja1O55176 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Pja1O55176 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pja1O55176 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pja1O55176 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pja1O55176 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pja1O55176 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pja1O55176 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pja1O55176 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Pja1O55176 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pja1O55176 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Pja1O55176 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pja1O55176 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pja1O55176 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pja1O55176 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pja1O55176 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pja1O55176 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pja1O55176 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pja1O55176 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pja1O55176 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms