Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CrxO54751 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CrxO54751 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CrxO54751 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CrxO54751 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CrxO54751 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CrxO54751 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CrxO54751 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CrxO54751 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CrxO54751 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CrxO54751 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CrxO54751 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CrxO54751 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CrxO54751 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CrxO54751 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CrxO54751 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CrxO54751 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CrxO54751 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CrxO54751 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CrxO54751 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CrxO54751 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CrxO54751 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CrxO54751 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CrxO54751 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CrxO54751 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CrxO54751 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CrxO54751 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CrxO54751 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CrxO54751 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CrxO54751 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CrxO54751 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CrxO54751 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CrxO54751 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CrxO54751 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CrxO54751 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CrxO54751 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CrxO54751 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CrxO54751 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CrxO54751 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CrxO54751 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CrxO54751 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CrxO54751 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CrxO54751 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CrxO54751 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CrxO54751 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CrxO54751 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CrxO54751 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CrxO54751 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CrxO54751 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CrxO54751 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CrxO54751 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CrxO54751 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CrxO54751 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CrxO54751 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CrxO54751 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CrxO54751 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CrxO54751 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CrxO54751 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrxO54751 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrxO54751 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrxO54751 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrxO54751 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrxO54751 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CrxO54751 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CrxO54751 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CrxO54751 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CrxO54751 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CrxO54751 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CrxO54751 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CrxO54751 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CrxO54751 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CrxO54751 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CrxO54751 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CrxO54751 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CrxO54751 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CrxO54751 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CrxO54751 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CrxO54751 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CrxO54751 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CrxO54751 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CrxO54751 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CrxO54751 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CrxO54751 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CrxO54751 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CrxO54751 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CrxO54751 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CrxO54751 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CrxO54751 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CrxO54751 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CrxO54751 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CrxO54751 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CrxO54751 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CrxO54751 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CrxO54751 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CrxO54751 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CrxO54751 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CrxO54751 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CrxO54751 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CrxO54751 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CrxO54751 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms